Bioconductor/BiocParallel

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Bioconductor facilities for parallel evaluation

Étoiles: 69
Forks: 32
Issues débutants ouvertes: 0
Issues indexées: 33

Langage dominant: R
Licence: Aucune donnée de licence
Dernier push GitHub: 29/4/2026
Dernière indexation: 21/9/2026
Guide de contribution: Aucun guide de contribution
Code de conduite: Aucun code de conduite
Labels débutants: Aucun label débutant indexé
Métriques de merge des PR: Aucune PR mergée en 30 j

Accessible aux débutants Tout

Ouverte Toutes

BatchtoolsParam handles reduce.in.order differently from others Ouverte

Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 65/100

Bioconductor/BiocParallel#286 · 1 commentaire · Ouverte le 28/5/2026
wrong args for environment subassignment Ouverte

Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 50/100

Bioconductor/BiocParallel#285 · Ouverte le 21/4/2026
futile.logger may be archived from CRAN Ouverte

Bioconductor/BiocParallel#284 · 2 commentaires · 1 personne assignée · Ouverte le 24/12/2025
Problem to kill jobs with Rstudio Ouverte

Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 25/100

Bioconductor/BiocParallel#283 · 2 commentaires · Ouverte le 16/12/2025
DoparParam: Captured stdout is relayed to stdout for some foreach adapters and stderr for others Ouverte

Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 35/100

Bioconductor/BiocParallel#277 · Ouverte le 19/5/2025
DoparParam: Disable capturing of stdout? Ouverte

Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 45/100

Bioconductor/BiocParallel#276 · Ouverte le 19/5/2025
accuracy of doc on bpexportvariables Ouverte

Bioconductor/BiocParallel#275 · 1 personne assignée · Ouverte le 16/4/2025
memory efficient parallel compting Ouverte

Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 20/100

Bioconductor/BiocParallel#274 · 4 commentaires · Ouverte le 16/4/2025
Installation Failure Ouverte

Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 25/100

Bioconductor/BiocParallel#273 · 1 commentaire · Ouverte le 10/4/2025
Build fails: `error: no matching function for call to 'get_rounded_size(const unsigned int:30&, const std::size_t&)'` Ouverte

Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 32/100

Bioconductor/BiocParallel#265 · 3 commentaires · Ouverte le 2/2/2025
BatchtoolsParam fails to propagate errors in bpiterate Ouverte

Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 35/100

Bioconductor/BiocParallel#257 · 2 commentaires · Ouverte le 7/7/2023
Handle worker abort better Ouverte

Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 35/100

Bioconductor/BiocParallel#249 · 1 commentaire · Ouverte le 12/4/2023
WISH: Support also SnowParam(type = "PSOCK") Ouverte

Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 65/100

Bioconductor/BiocParallel#231 · 6 commentaires · Ouverte le 14/11/2022
BiocParallel doesn't propagate warnings Ouverte

Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 42/100

Bioconductor/BiocParallel#216 · 3 commentaires · Ouverte le 20/7/2022
BiocParallel.so: undefined symbol: getrandom Ouverte

Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 25/100

Bioconductor/BiocParallel#139 · 1 réaction · Ouverte le 16/3/2021
BiocParallel:::.batchtoolsClusterAvailable() mistakes Torque for SGE Ouverte

Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 48/100

Bioconductor/BiocParallel#128 · Ouverte le 25/11/2020
BiocParallel fail to start with MPI Ouverte

Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 25/100

Bioconductor/BiocParallel#120 · 2 commentaires · Ouverte le 28/7/2020
Revise default param registration Ouverte

Difficulté 2/5 1-3 heures Accessibilité débutants 45/100

Bioconductor/BiocParallel#119 · 5 commentaires · Ouverte le 9/7/2020
ROBUSTNESS: Detect when forked process terminates Ouverte

enhancement

Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 35/100

Bioconductor/BiocParallel#112 · Ouverte le 5/3/2020
Import of BigWig files with rtracklayer fails under MultiCoreParam Ouverte

Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 35/100

Bioconductor/BiocParallel#111 · 21 commentaires · Ouverte le 4/3/2020
BatchtoolsParam and bpiterate: registry not empty error Ouverte

Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 35/100

Bioconductor/BiocParallel#107 · 1 réaction · Ouverte le 10/12/2019
Parallelization problems on Ubuntu Ouverte

Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 35/100

Bioconductor/BiocParallel#106 · 5 commentaires · 2 réactions · Ouverte le 2/12/2019
Making register() a generic Ouverte

Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 35/100

Bioconductor/BiocParallel#104 · 1 commentaire · Ouverte le 18/9/2019
BiocParallel does not keep logs during job failure Ouverte

Bioconductor/BiocParallel#103 · 2 commentaires · 1 personne assignée · Ouverte le 4/9/2019
Use of DoparParam Ouverte

Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 35/100

Bioconductor/BiocParallel#97 · 1 commentaire · Ouverte le 22/3/2019
usage of sockets by MulticoreParam Ouverte

Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 25/100

Bioconductor/BiocParallel#85 · 11 commentaires · Ouverte le 24/10/2018
Error using BiocParallel on Travis Ouverte

Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 30/100

Bioconductor/BiocParallel#61 · 5 commentaires · Ouverte le 30/12/2016
Allow recovery from fatal worker error Ouverte

enhancement

Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 45/100

Bioconductor/BiocParallel#53 · Ouverte le 25/1/2016
Loading an (arbitrary) package slows down bplapply() Ouverte

Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 25/100

Bioconductor/BiocParallel#47 · 1 commentaire · Ouverte le 21/12/2015
split/apply/combine paradigm Ouverte

enhancement

Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 20/100

Bioconductor/BiocParallel#29 · 6 commentaires · Ouverte le 12/12/2013
Automatically check that user code references exported, local, or attached package variables Ouverte

enhancement

Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 25/100

Bioconductor/BiocParallel#26 · 2 commentaires · Ouverte le 6/11/2013
Add bpexport functionality Ouverte

enhancement

Bioconductor/BiocParallel#24 · 9 commentaires · 1 personne assignée · Ouverte le 6/11/2013
Tests involving Bioconductor objects Ouverte

Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 25/100

Bioconductor/BiocParallel#9 · 2 commentaires · Ouverte le 8/12/2012

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