feat(scripts): read-only clone mode — add --skip-source-stage-update to import.py (pull-sequences)

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Evaluación

Dificultad
2/5
Tiempo estimado
1-3 horas
Aptitud para principiantes
78/100
Tipo de issue
Nueva funcionalidad
Claridad
Bastante claro
Estado de actividad
Tranquilo
Stack tecnológico
python
Área
api, backend

Línea de trabajo

Comienza en scripts/data_transfer/ingestion/platform/import.py alrededor de las líneas 803-809 y compara el precedente de --no-stage-update en pull_sequence_annotations.py. Ejecuta el comando clone proporcionado con --skip-source-stage-update y verifica que las secuencias se importen localmente sin llamar a update_source_annotations_stage() en el origen; considera las notas de pruebas locales de Makefile y README si están incluidas.

Escrito por el modelo de indexación a partir del texto del issue.

Descripción

Finding

make pull-sequences (clone mode of scripts/data_transfer/ingestion/platform/import.py) is not read-only against the source API: after a successful clone it PATCHes every cloned sequence's annotation on the source to under_annotation (update_source_annotations_stage(), called at import.py:803-809) to "claim" the sequences for workflow A.

That behavior is correct for the production annotation workflow, but it makes it impossible to hydrate a local API from the remote for testing/debugging without mutating remote state:

  • There is no flag to skip the source stage update.
  • --dry-run skips the source update but also skips the import itself, so it can't be used for hydration.
  • The equivalent flag exists in the pipeline-B pull script (pull_sequence_annotations.py --no-stage-update, read-only export) — but not in import.py.

Proposal

Add a --skip-source-stage-update flag to import.py (mirroring the --no-stage-update precedent) that guards the update_source_annotations_stage() call, so clone mode can run read-only against the source:

uv run python -m scripts.data_transfer.ingestion.platform.import \
  --source-annotation-url https://annotationapi.pyronear.org \
  --url-api-annotation http://localhost:5050 \
  --max-sequences 10 \
  --clone-processing-stage ready_to_annotate \
  --skip-source-stage-update

Optionally expose it through the Makefile (e.g. make pull-sequences READ_ONLY_SOURCE=1) and mention it in the README's local-testing notes.

Lenguaje dominante
TypeScript
Estrellas
0
Forks
1
Merge medio
2 d 6 h
PR fusionados (30 d)
4

Preparar el entorno

  • Incluye un Dockerfile o un archivo de Docker Compose
  • Sin plantilla de pull request
  • Sin guía de contribución

Primeros pasos

  1. Lee el issue completo y luego la guía de contribución del proyecto.
  2. Comenta en el issue que vas a ocuparte — evita que dos personas hagan lo mismo.
  3. Haz un fork del repositorio y trabaja en una rama.
  4. Abre un pull request que haga referencia al número del issue.

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