Hacktoberfest 2026: los issues que los mantenedores marcaron para octubre, abiertos y aptos para principiantes. Explorar issues de Hacktoberfest

nf-core/pairgenomealign

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Pairwise genome comparison pipeline using the LAST software to align a list of query genomes to a target genome, and plot the results

¿Es nf-core/pairgenomealign apto para principiantes?

Hemos visto muy pocos pull requests recientes de colaboradores externos en nf-core/pairgenomealign para saber con qué frecuencia se fusionan. Ahora mismo hay 4 issues aptos para principiantes abiertos.

Estrellas
11
Forks
6
Issues abiertos para principiantes
4
Issues indexados
18
Merge medio
7 h 49 min
PR fusionados (30 d)
4
Lenguaje dominante
Nextflow
Licencia
MIT
Último push a GitHub
8/10/2026
Última indexación
19/9/2026
Guía de contribución
Código de conducta
Etiquetas para principiantes
Sin etiquetas para principiantes indexadas

Cómo contribuir a nf-core/pairgenomealign

  1. Lee primero la guía de contribución: explica cómo quieren los mantenedores que se propongan, prueben y revisen los cambios.
  2. El proyecto incluye un dev container: ábrelo en Codespaces para tener un entorno que funciona en tu navegador.
  3. Lee su código de conducta: se aplica a los issues y pull requests igual que al chat.
  4. Elige uno de los 4 issues abiertos aptos para principiantes de abajo y comenta que quieres trabajar en él antes de empezar.
Para principiantes Todo
Abierto Todos

Las issues en las que quizá ya trabaja alguien aparecen al final. Ordenar todo por fecha

  • Allow GFA format for input genomes.
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    enhancement

    Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 58/100

    nf-core/pairgenomealign#168 ·

  • Document known limitations.
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    documentation

    Dificultad 1/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 83/100

    nf-core/pairgenomealign#167 ·

  • docs: many-to-one and one-to-many descriptions in output.md are inverted or incomplete
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    documentation

    Dificultad 1/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 88/100

    nf-core/pairgenomealign#166 ·

  • `ALIGNMENT_SPLIT_O2M` runs out of memory on large `--m2m` alignments: scale its memory with the input size
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    enhancement

    Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 75/100

    nf-core/pairgenomealign#162 ·

  • `-stub` runs fail at the split steps: LAST_SPLIT stub does not create `*.matrix.txt`
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    bug

    Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 82/100

    nf-core/pairgenomealign#161 ·

  • Documentation update: cutn/targetGenome
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    bug

    Dificultad 1/5 Menos de una hora Aptitud para principiantes 88/100

    nf-core/pairgenomealign#155 ·

  • Unnecessary differences with the TEMPLATE branch.
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    bug

    Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 35/100

    nf-core/pairgenomealign#153 ·

  • Reduce `last/split` diff
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    enhancement

    Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 58/100

    nf-core/pairgenomealign#152 ·

  • Improve `llms-full.txt`
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    enhancement

    Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 58/100

    nf-core/pairgenomealign#146 ·

  • `--targetName` mode
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    enhancement

    Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 55/100

    nf-core/pairgenomealign#137 ·

  • Merged BCF/VCF file support
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    enhancement

    Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 30/100

    nf-core/pairgenomealign#132 ·

  • Read alignment mode
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    enhancement

    Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 45/100

    nf-core/pairgenomealign#131 ·

  • Produce more annotation files for the target genome.
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    enhancement

    Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 35/100

    nf-core/pairgenomealign#125 ·

  • PAF export
    Quizá libre de nuevo Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    enhancement

    nf-core/pairgenomealign#123 · 1 comentario · 1 asignado ·

  • Labels misaligned on SVG tubemap
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    bug

    Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 30/100

    nf-core/pairgenomealign#103 ·

  • AWS full test workflow revision handling differs from nf-core standard
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 45/100

    nf-core/pairgenomealign#85 · 1 comentario ·

  • Transform `modules/local/multiqc_assemblyscan_plot_data` into an assemblyscan MultiQC module
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    enhancement

    Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 45/100

    nf-core/pairgenomealign#67 ·

  • Add a `--circular` option
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    enhancement

    Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 45/100

    nf-core/pairgenomealign#33 ·

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