mlr-org/batchtools

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Tools for computation on batch systems

Estrellas: 184
Forks: 53
Issues abiertos para principiantes: 0
Issues indexados: 88
Merge medio: 7 d 2 h
PR fusionados (30 d): 1

Lenguaje dominante: R
Licencia: LGPL-3.0
Último push a GitHub: 26/11/2025
Última indexación: 19/9/2026
Guía de contribución: Guía de contribución
Código de conducta: Sin código de conducta
Etiquetas para principiantes: help wanted

Para principiantes Todo

Abierto Todos

86 issues abiertos indexados

CRAN Taskview: Update needed Abierto

Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 35/100

mlr-org/batchtools#321 · Abierto el 21/10/2025
ROBUSTNESS: Write RDS files atomically Abierto

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 25/100

mlr-org/batchtools#317 · 1 comentario · Abierto el 17/8/2025
Parent job in slurm exits before child jobs | nested slurm jobs Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100

mlr-org/batchtools#315 · 1 comentario · Abierto el 15/8/2025
vignette link in readme is a dead link now Abierto

Dificultad 1/5 Menos de una hora Aptitud para principiantes 45/100

mlr-org/batchtools#305 · 2 comentarios · 1 reacción · Abierto el 13/5/2025
`loadRegistry` assigns exported objects into the global namespace Abierto

Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 48/100

mlr-org/batchtools#304 · 1 comentario · Abierto el 2/12/2024
Retry slurm-commands on error Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100

mlr-org/batchtools#303 · Abierto el 8/10/2024
Option to drop into 'recover' when running testJob throws an error Abierto

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 45/100

mlr-org/batchtools#302 · Abierto el 21/8/2024
Old version of Slurm, "invalid job state specified: SI" Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 42/100

mlr-org/batchtools#300 · 1 comentario · 1 reacción · Abierto el 15/1/2024
Creating jobs without package dependencies installed on head node Abierto

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 25/100

mlr-org/batchtools#298 · Abierto el 18/12/2023
Slurm resource named `clusters` in docs, and `cluster` in `getClusters` Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100

mlr-org/batchtools#297 · Abierto el 17/10/2023
calling `batchMap` + `submitJob` in a loop triggers "Registry must be empty" error Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 25/100

mlr-org/batchtools#295 · 1 comentario · Abierto el 26/6/2023
squeue cmd not found when running R targets on singularity docker image Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100

mlr-org/batchtools#294 · 1 comentario · Abierto el 16/5/2023
Effectively use batchtools for Targets-based workflow in SLURM Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 25/100

mlr-org/batchtools#292 · 4 comentarios · Abierto el 25/1/2023
Question: How are template files interpretted? Abierto

Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 25/100

mlr-org/batchtools#291 · 1 comentario · Abierto el 25/1/2023
Error in (function () : unused argument (x = 3) Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 25/100

mlr-org/batchtools#290 · 3 comentarios · Abierto el 14/1/2023
Make 'options(error = function(e) traceback(2))` optional in testJob Abierto

Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 50/100

mlr-org/batchtools#289 · Abierto el 27/9/2022
Edit the job template without clearing the entire registry Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100

mlr-org/batchtools#288 · Abierto el 23/9/2022
Yet another `BatchtoolsExpiration: Future ('<none>') expired` error Abierto

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 25/100

mlr-org/batchtools#285 · Abierto el 1/4/2022
makeClusterFunctions store.job.collection flag documentation Abierto

Dificultad 1/5 Menos de una hora Aptitud para principiantes 45/100

mlr-org/batchtools#284 · Abierto el 30/1/2022
ability to suppress warning on failure to source `source` when calling makeRegistry Abierto

Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 45/100

mlr-org/batchtools#281 · Abierto el 7/10/2021
Job requeue on Slurm - 'no such file or directory' & workaround Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 38/100

mlr-org/batchtools#280 · 2 comentarios · 1 reacción · Abierto el 24/7/2021
scoping errors depending on objects in global environment Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100

mlr-org/batchtools#275 · Abierto el 15/6/2021
Error in readLog() on Slurm cluster Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100

mlr-org/batchtools#273 · 12 comentarios · Abierto el 26/5/2021
Execution order of jobs in the same chunk Abierto

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 35/100

mlr-org/batchtools#272 · 1 reacción · Abierto el 9/4/2021
[Question] Dynamically change number of concurrent jobs Abierto

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 25/100

mlr-org/batchtools#270 · Abierto el 31/1/2021
Custom job submission command with TORQUE/PBS Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 25/100

mlr-org/batchtools#269 · Abierto el 16/1/2021
segfault in batchExport Abierto

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 20/100

mlr-org/batchtools#266 · Abierto el 29/9/2020
btlapply submitting to only a small number of nodes in Slurm Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 20/100

mlr-org/batchtools#265 · 1 reacción · Abierto el 28/8/2020
runOSCommand throws error with R 4.0 (missing shQuote) Abierto

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 42/100

mlr-org/batchtools#264 · 6 comentarios · 1 reacción · Abierto el 17/7/2020
option to overwrite registry file Abierto

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 45/100

mlr-org/batchtools#262 · 4 comentarios · Abierto el 12/6/2020
WISH: Clarify the 'Work dir does not exist' error message Abierto

Dificultad 1/5 Menos de una hora Aptitud para principiantes 45/100

mlr-org/batchtools#260 · 2 comentarios · Abierto el 9/4/2020
How to retrieve benchmark results from makeExperimentRegistry() Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 25/100

mlr-org/batchtools#249 · 2 comentarios · Abierto el 10/11/2019
Use the qs package for file transfers Abierto

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 25/100

mlr-org/batchtools#245 · 21 comentarios · Abierto el 11/9/2019
Trouble with LSF support Abierto

Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 50/100

mlr-org/batchtools#244 · Abierto el 10/9/2019
clusterFunctionsSlurm.R returns incorrect "batch.id" Abierto

Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 35/100

mlr-org/batchtools#243 · 1 comentario · Abierto el 7/9/2019
Mutlicore does not work properly (Warning in selectChildren) Abierto

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 42/100

mlr-org/batchtools#242 · 3 comentarios · 1 reacción · Abierto el 29/8/2019
Too many jobs causes "BatchtoolsExpiration: Future ('<none>') expired" Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100

mlr-org/batchtools#240 · 2 comentarios · Abierto el 13/8/2019
getLog() should not return an error if the log file is not available Abierto

Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 45/100

mlr-org/batchtools#239 · Abierto el 8/8/2019
Change package name after fork Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 25/100

mlr-org/batchtools#238 · 4 comentarios · Abierto el 15/7/2019
makeRegistry(NA) causes jobs to expire on Slurm cluster Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100

mlr-org/batchtools#237 · 3 comentarios · Abierto el 6/7/2019
Batchtools interacts poorly with packrat (probably renv also) Abierto

enhancement question

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100

mlr-org/batchtools#236 · Abierto el 4/7/2019
Recognise abuse behavior Abierto

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 25/100

mlr-org/batchtools#235 · 6 comentarios · Abierto el 29/6/2019
Socket parallelization + resizing the terminal window = crash Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 25/100

mlr-org/batchtools#233 · 3 comentarios · Abierto el 19/6/2019
Speedup reduceResultsDataTable with many (millions) of Jobs Abierto

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 25/100

mlr-org/batchtools#231 · 3 comentarios · Abierto el 6/6/2019
Specify username for Slurm Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 25/100

mlr-org/batchtools#229 · 3 comentarios · Abierto el 11/4/2019
SUGGESTION: Robustify example template files Abierto

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 35/100

mlr-org/batchtools#228 · Abierto el 29/3/2019
multicore collects children inappropriately Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100

mlr-org/batchtools#221 · 6 comentarios · Abierto el 11/2/2019
explicitly undo side effects of makeCluster Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 30/100

mlr-org/batchtools#220 · 2 comentarios · Abierto el 9/2/2019
Error message for successfully terminated jobs on LiDO3 Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 25/100

mlr-org/batchtools#219 · 2 comentarios · Abierto el 8/2/2019
Implement sharding Abierto

enhancement

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 20/100

mlr-org/batchtools#217 · 1 comentario · 1 reacción · Abierto el 24/1/2019

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