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lpipes

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tronko
A rapid phylogeny-based method for accurate community profiling of large-scale metabarcoding datasets

C · 27 estrellas

Para principiantes Todo

Abierto Todos

Any parameter to enhance stringency/accuracy? Abierto

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 25/100

lpipes/tronko#16 · Abierto el 17/4/2025
Support using both -s and -v together in tronko-build for improved partitioning Abierto

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 45/100

lpipes/tronko#15 · Abierto el 16/4/2025
18S database for tronko? Abierto

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 20/100

lpipes/tronko#14 · Abierto el 14/4/2025
Possibly wrong taxonomy assignment by tronko using the latest available COI database on Zenodo? Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100

lpipes/tronko#12 · 3 comentarios · Abierto el 6/4/2025
More info on the pre-built COI databases Abierto

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 42/100

lpipes/tronko#10 · Abierto el 26/3/2025

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