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Some notes on alignment with pangeo-forge-recipes around "keys"

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Evaluación

Dificultad
5/5
Tiempo estimado
Más de una semana
Aptitud para principiantes
25/100
Tipo de issue
Refactorización
Claridad
Necesita aclaración
Estado de actividad
Estancado
Stack tecnológico
python
Área
data-engineering, distributed-systems

Línea de trabajo

Empieza leyendo la documentación de Xarray Beam keys y las líneas 70-114 referenciadas de pangeo_forge_recipes/patterns.py. Compara esas abstracciones con el manejo de índices en FilePatterns y en la escritura paralela de Zarr. El issue no define un cambio concreto ni criterios de aceptación, por lo que se necesita una decisión de los maintainers antes de la implementación.

Escrito por el modelo de indexación a partir del texto del issue.

Descripción

At today's Pangeo Forge meeting, @alxmrs told us a bit more about Xarray Beam. I'm happy to note that we are aligning a bit around certain abstractions. I'm not proposing to merge or share code or anything at this stage. Just happy to see that we have independently arrived at some similar concepts. Comparing side by side may also suggest improvements.

Xarray Beam

https://xarray-beam.readthedocs.io/en/latest/data-model.html#keys-in-xarray-beam

To keep track of how individual records could be combined into a larger (virtual) dataset, Xarray-Beam defines a Key object. > Key objects consist of:

  • offsets: integer offests for chunks from the origin in an immutabledict
  • vars: The subset of variables included in each chunk, either as a frozenset, or as None to indicate “all variables”.
Pangeo Forge

We currently call this an "index," although I agree that key is a better name. Our use of indexes is less well documented as it is not really public API but more of an internal thing. We mention it here: https://pangeo-forge.readthedocs.io/en/latest/recipe_user_guide/file_patterns.html#inspect-a-filepattern

The index is its own special type of object used internally by recipes, a pangeo_forge_recipes.patterns.Index, (which is basically a tuple of one or more pangeo_forge_recipes.patterns.DimIndex objects).

The code is pretty straightforward and the comments explain things better.

https://github.com/pangeo-forge/pangeo-forge-recipes/blob/49997cb52cff466bd394c1348ef23981e782a4d9/pangeo_forge_recipes/patterns.py#L70-L114

These indexes are used both by FilePatterns (see #31) as well as for parallel writing of Zarr datasets.

cc @cisaacstern

Lenguaje dominante
Python
Estrellas
170
Forks
15
Merge medio
23 h 20 min
PR fusionados (30 d)
2

Preparar el entorno

Primeros pasos

  1. Lee el issue completo y luego la guía de contribución del proyecto.
  2. Comenta en el issue que vas a ocuparte — evita que dos personas hagan lo mismo.
  3. Haz un fork del repositorio y trabaja en una rama.
  4. Abre un pull request que haga referencia al número del issue.

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