core.py's Job class default regex not selecting correct job id
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Evaluación
- Dificultad
- 3/5
- Tiempo estimado
- 1-2 días
- Aptitud para principiantes
- 45/100
Línea de trabajo
Comienza en core.py con la clase Job y _job_id_from_submit_output; después, inspecciona cómo se analiza qsub stdout cuando los mensajes del wrapper preceden al id del trabajo. Determina cómo la regex predeterminada debería evitar esos mensajes y verifica que el valor seleccionado sea el id real del trabajo en una salida que contenga texto informativo, números y saltos de línea.
Escrito por el modelo de indexación a partir del texto del issue.
Descripción
I have a python code that uses dask_jobqueue's PBSCluster to manage workers on an HPC.
Within this environment, the qsub command calls a wrapper which does several important things for the environment before actually qsubbing the job. This wrapper sometimes prints informational messages to stdout (these messages contain text, numbers, newlines, etc) before listing the job id.
When this happens, the default regex for core.py's Job class ( (?P<job_id>\d+) ) will pull out the wrong string thinking it is the job id when it is in fact not.
One solution I had to this problem was subclassing Job and making _job_id_from_submit_output apply the regex to the last line of the stdout from qsub. I suppose I could also change the regex to something more robust too.
In practice the workarounds would be sufficient, however every change made to already existing software that uses dask at my work requires recertification, which draws more resources.
- Lenguaje dominante
- Python
- Estrellas
- 256
- Forks
- 149
- Métricas de merge de PR
- Sin PR fusionados en 30 d
Preparar el entorno
- Sin Dockerfile ni archivo de Docker Compose
- Sin plantilla de pull request
- Leer la guía de contribución
Primeros pasos
- Lee el issue completo y luego la guía de contribución del proyecto.
- Comenta en el issue que vas a ocuparte — evita que dos personas hagan lo mismo.
- Haz un fork del repositorio y trabaja en una rama.
- Abre un pull request que haga referencia al número del issue.
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