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common-workflow-language
21 repositorios indexados · Ver en GitHub
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common-workflow-language
Repository for the CWL standards. Use https://cwl.discourse.group/ for support 😊
Common Workflow Language · 1479 estrellas
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cwltool
Common Workflow Language reference implementation
Python · 376 estrellas
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schema_salad
Semantic Annotations for Linked Avro Data
Python · 86 estrellas
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cwlviewer
A web application to view and share Common Workflow Language workflows
Java · 52 estrellas
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cwl-v1.2
Released CWL v1.2.1 specification
Common Workflow Language · 45 estrellas
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Python utilities for CWL
Python · 43 estrellas
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The CWL v1.0 - v1.2 user guide
Common Workflow Language · 42 estrellas
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Implementation of the GA4GH Workflow Execution Service, a REST service for running workflows
Python · 39 estrellas
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cwlprov
Profile for provenance research object of a CWL workflow run
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cwltest
Framework for testing CWL tools and workflows
Python · 20 estrellas
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cwljava
Java SDK for the Common Workflow Language standards
Java · 16 estrellas
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cwl-website
www.commonwl.org
JavaScript · 10 estrellas
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cwl-intro-gui-workshop
Materials to teach workshop about CWL using the Rabix Composer
Common Workflow Language · 8 estrellas
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cwl-upgrader
Upgrade CWL syntax to a newer version
Python · 7 estrellas
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Common Workflow Language · 6 estrellas
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media
CWL logo source
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cwlprov-py
cwlprov: Command line tool and Python API to explore Research Objects containing provenance of Common Workflow Language executions
Python · 5 estrellas
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governance
Holds public material generated by and for the CWL board.
HTML · 4 estrellas
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for_novices
One page CWL explainer for workflow novices
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for_decision_makers
One page CWL explainer for Business/policy decision makers
1 estrella
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Las issues en las que quizá ya trabaja alguien aparecen al final. Ordenar todo por fecha
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Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 75/100
common-workflow-language/cwl-utils#477 · 1 comentario ·
Los mantenedores suelen responder en 1 día
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Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 63/100
common-workflow-language/cwl-utils#475 · 1 comentario ·
Los mantenedores suelen responder en 1 día
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Embedded process with a different cwlVersion rejected since 0.43 — should it be ignored instead?Abierto
Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 45/100
common-workflow-language/cwl-utils#470 · 2 comentarios ·
Los mantenedores suelen responder en 1 día
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Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 48/100
common-workflow-language/cwl-utils#467 · 4 comentarios ·
Los mantenedores suelen responder en 1 día
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Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100
common-workflow-language/cwltool#2353 · 5 comentarios ·
Los mantenedores suelen responder en 1 día
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Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 25/100
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Dificultad 1/5 Menos de una hora Aptitud para principiantes 92/100
common-workflow-language/cwlprov-py#42 · 2 comentarios ·
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Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 65/100
common-workflow-language/cwltool#2343 ·
Los mantenedores suelen responder en 1 día
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Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 68/100
common-workflow-language/cwltool#2337 · 2 comentarios ·
Los mantenedores suelen responder en 1 día
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`--single-step <stepname>` plus `--help` to list the inputs doesn't produce the correct resultsAbierto
Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 58/100
common-workflow-language/cwltool#2299 ·
Los mantenedores suelen responder en 1 día
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`format_checking` test can fail spuriously because `rev` no longer ships by default on some systemsAbierto
Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 68/100
common-workflow-language/cwl-v1.2#307 · 1 comentario ·
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Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 55/100
common-workflow-language/cwltool#2298 ·
Los mantenedores suelen responder en 1 día
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Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 78/100
common-workflow-language/cwltool#2296 ·
Los mantenedores suelen responder en 1 día
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Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 55/100
common-workflow-language/cwltool#2295 · 3 comentarios ·
Los mantenedores suelen responder en 1 día
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Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 55/100
common-workflow-language/cwltool#2282 · 1 comentario ·
Los mantenedores suelen responder en 1 día
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Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 72/100
common-workflow-language/cwltest#294 · 2 comentarios · 1 reacción ·
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Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 48/100
common-workflow-language/cwltest#289 · 1 reacción ·
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Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 45/100
common-workflow-language/cwltool#2270 ·
Los mantenedores suelen responder en 1 día
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Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 45/100
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CWLViewer fails to render a workflow, possibly due to commas in the nameQuizá libre de nuevo @kinow la tomó hace 158 días y no hay ningún pull request abierto. Abierto
common-workflow-language/cwlviewer#782 · 6 comentarios · 1 asignado ·
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Conformance tests failing on BSC MareNostrum5 due to home directories being symlinks to GPFSAbierto
Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 57/100
common-workflow-language/cwltest#281 · 1 comentario ·
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Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 58/100
common-workflow-language/cwltool#2251 ·
Los mantenedores suelen responder en 1 día
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`--validate` should check for `baseCommand` presence on PATH or in containersQuizá libre de nuevo Un pull request para esta issue se cerró sin fusionarse. Abiertogood first issue
Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 55/100
common-workflow-language/cwltool#2240 · 1 comentario ·
Los mantenedores suelen responder en 1 día
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Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 52/100
common-workflow-language/cwltool#2236 · 2 comentarios ·
Los mantenedores suelen responder en 1 día
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null wrongly requires quotingAbierto
Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 65/100
common-workflow-language/cwltool#2221 ·
Los mantenedores suelen responder en 1 día
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`loadListing` behavior in workflow stepsQuizá libre de nuevo @mr-c la tomó hace 216 días y no hay ningún pull request abierto. Abierto
common-workflow-language/cwltool#2218 · 2 comentarios · 1 asignado ·
Los mantenedores suelen responder en 1 día
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Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 42/100
common-workflow-language/cwltool#2217 ·
Los mantenedores suelen responder en 1 día
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good first issue
Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 42/100
common-workflow-language/cwltool#2212 ·
Los mantenedores suelen responder en 1 día
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Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 45/100
common-workflow-language/cwl-v1.3#93 · 1 reacción ·
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extra inputs not specified in the target CWL process should not be present in the input objectAbierto
Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 20/100
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codegen: add tree-sitter supportAbierto
Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 25/100
common-workflow-language/schema_salad#1002 · 2 comentarios ·
Los mantenedores suelen responder en 1 día
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Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100
common-workflow-language/cwltool#2200 · 2 reacciones ·
Los mantenedores suelen responder en 1 día
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Clean up documentationAbierto
Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 25/100
common-workflow-language/cwl-website#229 · 1 comentario · 1 reacción ·
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Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 55/100
common-workflow-language/cwltool#2182 ·
Los mantenedores suelen responder en 1 día
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Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100
common-workflow-language/cwltool#2175 · 1 comentario ·
Los mantenedores suelen responder en 1 día
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Schema already in use errorAbierto
Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 30/100
common-workflow-language/cwltool#2167 · 6 comentarios ·
Los mantenedores suelen responder en 1 día
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Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100
common-workflow-language/cwltool#2164 · 1 comentario ·
Los mantenedores suelen responder en 1 día
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Allow inverse of `--no-eval`?Abierto
Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 30/100
common-workflow-language/cwltool#2151 ·
Los mantenedores suelen responder en 1 día
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Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 52/100
common-workflow-language/cwltest#249 · 1 comentario · 1 reacción ·
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Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100
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Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 45/100
common-workflow-language/cwltool#2139 ·
Los mantenedores suelen responder en 1 día
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cwltool --pack generates an invalid json when input contains a nested optional multi-type schemaQuizá libre de nuevo @alexiswl la tomó hace 487 días y no hay ningún pull request abierto. Abierto
common-workflow-language/cwltool#2126 · 1 asignado ·
Los mantenedores suelen responder en 1 día
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Dificultad 1/5 Menos de una hora Aptitud para principiantes 25/100
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Discrepancy in how --auth token is usedQuizá libre de nuevo @tetron la tomó hace 521 días y no hay ningún pull request abierto. Abierto
common-workflow-language/workflow-service#142 · 3 comentarios · 1 asignado ·
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Settings from ~/.config/arvados/settings.conf are not picked upQuizá libre de nuevo @tetron la tomó hace 522 días y no hay ningún pull request abierto. Abierto
common-workflow-language/workflow-service#141 · 1 asignado ·
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Cwltool logo proposalAbierto
Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 20/100
common-workflow-language/cwltool#2115 ·
Los mantenedores suelen responder en 1 día
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Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 30/100
common-workflow-language/cwltool#2112 · 1 comentario ·
Los mantenedores suelen responder en 1 día
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Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100
common-workflow-language/cwltool#2087 ·
Los mantenedores suelen responder en 1 día
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Issue with Docker tag handlingAbierto
Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 35/100
common-workflow-language/cwl-utils#339 · 1 comentario ·
Los mantenedores suelen responder en 1 día
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Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 30/100
common-workflow-language/cwl-v1.3#62 · 6 comentarios ·
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