Hacktoberfest 2026: los issues que los mantenedores marcaron para octubre, abiertos y aptos para principiantes. Explorar issues de Hacktoberfest

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cellarium-ai

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  • API: add docs
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 3/5 Medio día Aptitud para principiantes 45/100

    cellarium-ai/cellarium-ml#436 ·

  • API: CellariumDataView
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 25/100

    cellarium-ai/cellarium-ml#433 ·

  • StreamingPlaidGeometricSketch: fix cover problem
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 48/100

    cellarium-ai/cellarium-ml#431 ·

  • docker: gsutil issue
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 1/5 Menos de una hora Aptitud para principiantes 82/100

    cellarium-ai/cellarium-ml#417 ·

  • Fix incompatibility with Pandas >= 3
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 50/100

    cellarium-ai/cellarium-cas#131 ·

  • socam: class balancing accounting for dataset
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 25/100

    cellarium-ai/cellarium-ml#408 · 1 comentario ·

  • scvi: refactor
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 48/100

    cellarium-ai/cellarium-ml#394 ·

  • Add docs about HVG methods in cellarium-ml
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 48/100

    cellarium-ai/cellarium-ml#392 ·

  • slim down docker image?
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 30/100

    cellarium-ai/cellarium-ml#379 ·

  • Docker action manual trigger issue
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 80/100

    cellarium-ai/cellarium-ml#378 ·

  • scvi: make batch key optional for predict
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 65/100

    cellarium-ai/cellarium-ml#377 ·

  • Restrict users from changing maximum number of requests submitted
    Quizá libre de nuevo Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    cellarium-ai/cellarium-cas#127 · 1 comentario · 1 asignado ·

  • cpu_transforms issues
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    bug

    Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 42/100

    cellarium-ai/cellarium-ml#376 ·

  • DivideByScale seems to not be moving scale_g to correct device
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    bug

    Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 45/100

    cellarium-ai/cellarium-ml#375 · 1 comentario ·

  • DataModule should look up first and last shard size on start
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 48/100

    cellarium-ai/cellarium-ml#373 · 1 comentario ·

  • Tool for pseudobulking / aggregating data
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 25/100

    cellarium-ai/cellarium-ml#355 · 3 comentarios ·

  • Limit results to a specific tissue
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    enhancement

    Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 38/100

    cellarium-ai/cellarium-cas#120 ·

  • WeightsUnpickler error on load from checkpoint
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 48/100

    cellarium-ai/cellarium-ml#353 · 3 comentarios ·

  • t-digest median outputs nan values sometimes
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    bug

    Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 30/100

    cellarium-ai/cellarium-ml#346 ·

  • Cold-start wait warning
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    enhancement

    Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 25/100

    cellarium-ai/cellarium-cas#118 · 1 comentario ·

  • Installation issues
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 32/100

    cellarium-ai/cellarium-ml#340 · 1 comentario ·

  • nmf: implement marker gene finding in NMFOutput
    Quizá libre de nuevo Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    enhancement

    cellarium-ai/cellarium-ml#339 · 1 asignado ·

  • jax+pytorch lightning speed up
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    enhancement

    Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 20/100

    cellarium-ai/cellarium-ml#334 ·

  • data loaders: only load parts of a file?
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    discussion

    Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 25/100

    cellarium-ai/cellarium-ml#329 · 3 comentarios ·

  • Improve error messages
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 35/100

    cellarium-ai/cellarium-ml#327 ·

  • usability: remove "limits" input to DistributedAnnDataCollection
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100

    cellarium-ai/cellarium-ml#326 · 6 comentarios ·

  • spatial: explore the possibility of using anndata backed mode for file reading
    Quizá libre de nuevo Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    enhancement

    cellarium-ai/cellarium-ml#322 · 5 comentarios · 1 asignado ·

  • Spatial dataloader project
    Quizá libre de nuevo Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    discussion enhancement

    Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 12/100

    cellarium-ai/cellarium-ml#321 ·

  • preprocessing: implement "filter_genes"
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    enhancement

    Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 25/100

    cellarium-ai/cellarium-ml#315 ·

  • ClientConnectionError for 8k cells submitted to the beta CAS model
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 38/100

    cellarium-ai/cellarium-cas#109 ·

  • Weekly quota not reset
    Quizá libre de nuevo Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    cellarium-ai/cellarium-cas#108 · 1 comentario · 1 asignado ·

  • PredictionWriter: allow direct write to cloud
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    enhancement

    Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 25/100

    cellarium-ai/cellarium-ml#290 ·

  • nmf: make data scaling into a real Transform where default is what cNMF does
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 25/100

    cellarium-ai/cellarium-ml#283 · 2 comentarios ·

  • nmf: other kinds of consensus
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 20/100

    cellarium-ai/cellarium-ml#272 ·

  • Support for Mouse Data Annotation or Additional Trained Models
    Quizá libre de nuevo Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    cellarium-ai/cellarium-cas#102 · 1 comentario · 1 asignado ·

  • Improving UX as it relates to input AnnData gene symbol/ID annotations
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    enhancement good first issue help wanted high priority feature request

    Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 25/100

    cellarium-ai/cellarium-cas#101 ·

  • Defaults for CLI `predict` configs: default "obs_names_n" batch_key and default `PredictionWriter`
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 25/100

    cellarium-ai/cellarium-ml#266 · 1 comentario ·

  • Allow `PredictionWriter` to create different kinds of saved output
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 25/100

    cellarium-ai/cellarium-ml#265 · 1 comentario ·

  • More user-friendly instantiation of DistributedAnnDataCollection
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    enhancement

    Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 25/100

    cellarium-ai/cellarium-ml#262 · 1 comentario ·

  • Alternative, simpler, interactive view of the CAS output
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    enhancement

    Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100

    cellarium-ai/cellarium-cas#98 ·

  • Make gene symbols optional
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 45/100

    cellarium-ai/cellarium-cas#97 ·

  • Extract disease status metadata from Cellarium output
    Quizá libre de nuevo Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    high priority feature request

    cellarium-ai/cellarium-cas#95 · 1 comentario · 1 asignado ·

  • Add automatic conversion to sparse maticies
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    enhancement

    Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 42/100

    cellarium-ai/cellarium-cas#94 ·

  • YAML improvement - do not specify model if using a checkpoint
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 20/100

    cellarium-ai/cellarium-ml#260 · 4 comentarios ·

  • cNMF - user experience
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 20/100

    cellarium-ai/cellarium-ml#257 ·

  • scvi: NaNs on apple M2 silicon
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    wontfix

    Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100

    cellarium-ai/cellarium-ml#255 · 2 comentarios ·

  • Add support for `SequentialLR`
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 15/100

    cellarium-ai/cellarium-ml#249 ·

  • Add `if TYPE_CHECKING` clauses to imports
    Quizá libre de nuevo Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 35/100

    cellarium-ai/cellarium-ml#247 ·

  • `cpu_transforms` do not get switched to `eval` mode during vaildation
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    bug

    Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 20/100

    cellarium-ai/cellarium-ml#243 ·

  • Add `ComputeNorm` callback
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    enhancement

    Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 32/100

    cellarium-ai/cellarium-ml#242 ·

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