bioepic-data

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• Which column names a root variable's axis order (Primary axes, Secondary axes)?

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  Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 15/100

  bioepic-data/bervo#161 · 1 comentario · Abierto el 8/10/2026

  Los mantenedores suelen responder en 1 día

• Five rows whose label and definition disagree, left out of the #83 sweep

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  Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 30/100

  bioepic-data/bervo#160 · 1 comentario · Abierto el 8/10/2026

  Los mantenedores suelen responder en 1 día

• Settle what value_types means before filling it on 1,645 variables

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  Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 10/100

  bioepic-data/bervo#159 · 1 comentario · Abierto el 8/10/2026

  Los mantenedores suelen responder en 1 día

• Add Cumulative and Yearly to the 44 _CumYr variables

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  Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 35/100

  bioepic-data/bervo#158 · 1 comentario · Abierto el 8/10/2026

  Los mantenedores suelen responder en 1 día

• Process hierarchy: Chemical transformation sits beside terms it covers; Erosion and Uptake sit under Concept

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  Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 18/100

  bioepic-data/bervo#157 · 1 comentario · Abierto el 8/10/2026

  Los mantenedores suelen responder en 1 día

• Iron and aluminum hydroxide concepts: wrong synonyms, and one concept standing for three species

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  Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 25/100

  bioepic-data/bervo#156 · 1 comentario · Abierto el 8/10/2026

  Los mantenedores suelen responder en 1 día

• Microbial gases transformation (BERVO:0000919, 0000920) is net microbial gas uptake

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  Dificultad 3/5 Medio día Aptitud para principiantes 70/100

  bioepic-data/bervo#155 · 1 comentario · Abierto el 8/10/2026

  Los mantenedores suelen responder en 1 día

• Total adsorbed hydroxide transformation non-band (BERVO:0001732) is the whole adsorbed-species array

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  Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 30/100

  bioepic-data/bervo#154 · 1 comentario · Abierto el 8/10/2026

  Los mantenedores suelen responder en 1 día

• Soil electrical conductivity (BERVO:0000916) is EcoSIM's per-column soil ion content

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  Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 65/100

  bioepic-data/bervo#153 · 1 comentario · Abierto el 8/10/2026

  Los mantenedores suelen responder en 1 día

• Audit the 2025 mnemonic-ID ontology for terms missing from bervo-src.csv

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  Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 15/100

  bioepic-data/bervo#146 · 1 comentario · Abierto el 8/10/2026

  Los mantenedores suelen responder en 1 día

• Remove or repair the dead root Makefile

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  Dificultad 2/5 Menos de una hora Aptitud para principiantes 70/100

  bioepic-data/bervo#145 · 1 comentario · Abierto el 8/10/2026

  Los mantenedores suelen responder en 1 día

• Total flux from fire (BERVO:0001053) is the oxygen flux but its label doesn't say so

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  Dificultad 1/5 Menos de una hora Aptitud para principiantes 72/100

  bioepic-data/bervo#142 · Abierto el 6/10/2026

  Los mantenedores suelen responder en 1 día

• BERVO:0001273's label and definition describe sediment, not the adsorbed chemicals it measures

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  Dificultad 2/5 Medio día Aptitud para principiantes 70/100

  bioepic-data/bervo#136 · 1 comentario · Abierto el 6/10/2026

  Los mantenedores suelen responder en 1 día

• Leaf rubisco and PEP carboxylase contents are fractions of leaf protein in EcoSIM, not per leaf mass

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  Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 65/100

  bioepic-data/bervo#132 · 2 comentarios · Abierto el 25/9/2026

  Los mantenedores suelen responder en 1 día

• NA in relationship columns is a bulk default, not a curated 'not applicable'

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  Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 35/100

  bioepic-data/bervo#127 · 1 comentario · Abierto el 25/9/2026

  Los mantenedores suelen responder en 1 día

• Decide how the Partitioning concept is used, and restore it on BERVO:0001668

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  Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 25/100

  bioepic-data/bervo#125 · 1 comentario · Abierto el 25/9/2026

  Los mantenedores suelen responder en 1 día

• Decide whether respiration variables measure carbon or carbon dioxide

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  Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 35/100

  bioepic-data/bervo#124 · 1 comentario · Abierto el 25/9/2026

  Los mantenedores suelen responder en 1 día

• Add terms for soil classification systems

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  Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 55/100

  bioepic-data/bervo#120 · 1 comentario · Abierto el 24/9/2026

  Los mantenedores suelen responder en 1 día

• Exchange capacities: charge units (ceq) vs amount (cmol)

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  Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 58/100

  bioepic-data/bervo#119 · 1 comentario · Abierto el 24/9/2026

  Los mantenedores suelen responder en 1 día

• Soil coarse fraction: basis and size cut-off vary by domain

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  Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 35/100

  bioepic-data/bervo#118 · 1 comentario · Abierto el 24/9/2026

  Los mantenedores suelen responder en 1 día

• Say that Wrack cover and litter cover are parts of Unvegetated cover

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  Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 72/100

  bioepic-data/bervo#113 · 1 comentario · Abierto el 24/9/2026

  Los mantenedores suelen responder en 1 día

• Sort the 19 dimensionless Count rows into counts, indices, and durations

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  Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 45/100

  bioepic-data/bervo#112 · 1 comentario · Abierto el 24/9/2026

  Los mantenedores suelen responder en 1 día

• 15 grid-cell totals are defined as concentrations

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  Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 38/100

  bioepic-data/bervo#109 · 1 comentario · Abierto el 24/9/2026

  Los mantenedores suelen responder en 1 día

• Model categorical variables and the values they can take

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  Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 28/100

  bioepic-data/bervo#108 · 2 comentarios · Abierto el 23/9/2026

  Los mantenedores suelen responder en 1 día

• Link the existing variables to the quantity concepts added in #101

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  Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 35/100

  bioepic-data/bervo#105 · 1 comentario · Abierto el 23/9/2026

  Los mantenedores suelen responder en 1 día

• just next-id should skip retired IDs and optionally fill open gaps

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  Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 48/100

  bioepic-data/bervo#103 · 1 comentario · Abierto el 23/9/2026

  Los mantenedores suelen responder en 1 día

• Temperature change is parented as a kind of temperature

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  Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 35/100

  bioepic-data/bervo#102 · 1 comentario · Abierto el 23/9/2026

  Los mantenedores suelen responder en 1 día

• How should the variables at saturation name that state?

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  Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 35/100

  bioepic-data/bervo#97 · 1 comentario · Abierto el 22/9/2026

  Los mantenedores suelen responder en 1 día

• Mixed relation cells in the field capacity family: measurement_ofs on the log potentials, measured_ins on the irrigation thresholds

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  Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 48/100

  bioepic-data/bervo#96 · 1 comentario · Abierto el 22/9/2026

  Los mantenedores suelen responder en 1 día

• Wrong or inconsistent has_units in the soil water retention rows

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  Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 48/100

  bioepic-data/bervo#95 · 1 comentario · Abierto el 22/9/2026

  Los mantenedores suelen responder en 1 día

• Soil capillary pressure is defined as equal to the matric potential, and both rows claim the same EcoSIM slot

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  bioepic-data/bervo#93 · 1 comentario · Abierto el 22/9/2026

  Los mantenedores suelen responder en 1 día

• Heat capacity and Heat content are parented as kinds of heat, not as properties of it

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  bioepic-data/bervo#91 · 1 comentario · Abierto el 22/9/2026

  Los mantenedores suelen responder en 1 día

• Link the variable terms to the concepts added in September 2026

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  bioepic-data/bervo#83 · 1 comentario · Abierto el 21/9/2026

  Los mantenedores suelen responder en 1 día

• Total soil nitrate and nitrite content names Nitrogen dioxide where it means Nitrite

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  Dificultad 1/5 Menos de una hora Aptitud para principiantes 72/100

  bioepic-data/bervo#79 · 1 comentario · Abierto el 18/9/2026

  Los mantenedores suelen responder en 1 día

• Should BERVO distinguish directly observed field values from calculated or modelled ones?

  Abierto

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  Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 25/100

  bioepic-data/bervo#78 · 1 comentario · Abierto el 18/9/2026

  Los mantenedores suelen responder en 1 día

• Where should the constants live: under Variable, under Concept, or in the concept ID block?

  Abierto

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  Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 25/100

  bioepic-data/bervo#76 · 1 comentario · Abierto el 18/9/2026

  Los mantenedores suelen responder en 1 día

• Snow volume in snowpack (water equivalent) and Water equivalent snowpack read as duplicates but are not

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  Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 72/100

  bioepic-data/bervo#67 · 1 comentario · Abierto el 17/9/2026

  Los mantenedores suelen responder en 1 día

• Record chemical composition of compound terms, which #59 dropped as is-a edges

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  Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 28/100

  bioepic-data/bervo#60 · 1 comentario · Abierto el 3/9/2026

  Los mantenedores suelen responder en 1 día

• Nothing checks the hand-written ROBOT template strings in AGENTS.md and SKILL.md against the CSV

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  Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 70/100

  bioepic-data/bervo#57 · 1 comentario · Abierto el 29/8/2026

  Los mantenedores suelen responder en 1 día

• Verify the necromass claim in Microbial residual hydrolysis (BERVO:8000575) against EcoSIM

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  Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 43/100

  bioepic-data/bervo#53 · 1 comentario · Abierto el 28/8/2026

  Los mantenedores suelen responder en 1 día

• Two pairs of near-duplicate concept terms, and the validator gap that hides them

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  Dificultad 4/5 1-2 días Aptitud para principiantes 48/100

  bioepic-data/bervo#52 · 2 comentarios · Abierto el 28/8/2026

  Los mantenedores suelen responder en 1 día

• ROBOT heap setting in qc.yml is inert: ROBOT_ENV is passed as a make variable the Makefile never reads

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  Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 54/100

  bioepic-data/bervo#49 · 1 comentario · Abierto el 28/8/2026

  Los mantenedores suelen responder en 1 día

• 6,947 junk rdf:resource="NA" axioms from NA sentinels in IRI-valued columns

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  bioepic-data/bervo#44 · Abierto el 28/8/2026

  Los mantenedores suelen responder en 1 día

• 80% of cross-references are emitted as broken relative IRIs (COMO and MIXS prefixes undeclared)

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  bioepic-data/bervo#43 · Abierto el 28/8/2026

  Los mantenedores suelen responder en 1 día

• Stale purl.obolibrary.org prefix makes three QC checks vacuous; ID ranges file omits the 8xxxxxx and 9xxxxxx blocks

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  bioepic-data/bervo#40 · Abierto el 28/8/2026

  Los mantenedores suelen responder en 1 día

• BERVO and EcoPortal

  Abierto

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  bioepic-data/bervo#28 · Abierto el 12/3/2026

  Los mantenedores suelen responder en 1 día

• include complete set of plant functional traits

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  bioepic-data/bervo#27 · 1 comentario · Abierto el 29/1/2026

  Los mantenedores suelen responder en 1 día

• Get this ontology included in OLS

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  bioepic-data/bervo#17 · 1 comentario · Abierto el 1/7/2025

  Los mantenedores suelen responder en 1 día

• Add license

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  bioepic-data/bervo#10 · Abierto el 29/5/2025

  Los mantenedores suelen responder en 1 día

• Clean up duplicate entries, definitions, and labels

  Quizá libre de nuevo @jinyuntang la tomó hace 466 días y no hay ningún pull request abierto. Abierto

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  bioepic-data/bervo#9 · 1 comentario · 1 asignado · Abierto el 29/5/2025

  Los mantenedores suelen responder en 1 día