Inputs for `run_cwl`
Nadie ha tomado este issue todavía.
Evaluación
- Dificultad
- 3/5
- Tiempo estimado
- 1-2 días
- Aptitud para principiantes
- 35/100
Línea de trabajo
Empieza leyendo bco-tool/bco_runner.py alrededor de la línea 201 y sigue cómo run_cwl recibe actualmente su entrada YAML. Se considera hecho cuando el objeto de entrada de CWL se deriva del propio BCO en lugar de un archivo YAML separado; el issue no menciona ninguna prueba, así que identifica cualquier prueba existente relevante de run_cwl antes de hacer cambios.
Escrito por el modelo de indexación a partir del texto del issue.
Descripción
Ideally the CWL input object is constructed from the BCO itself, not a YAML
https://github.com/HadleyKing/bco-tool/blob/4a57078f79781bb95e3e2e6866e7a2b15c708a41/bco-tool/bco_runner.py#L201
- Lenguaje dominante
- Python
- Estrellas
- 2
- Forks
- 5
- Métricas de merge de PR
- Sin PR fusionados en 30 d
Preparar el entorno
Este proyecto no incluye contenedor de desarrollo, Dockerfile ni guía de contribución, así que la configuración corre por tu cuenta: empieza por su README y consulta nuestra guía para la primera contribución para los pasos generales.
Primeros pasos
- Lee el issue completo y luego la guía de contribución del proyecto.
- Comenta en el issue que vas a ocuparte — evita que dos personas hagan lo mismo.
- Haz un fork del repositorio y trabaja en una rama.
- Abre un pull request que haga referencia al número del issue.
Más de biocompute-objects/bcotool
-
might not be deterministicQuizá libre de nuevo @HadleyKing la tomó hace 1390 días y no hay ningún pull request abierto. Abierto
biocompute-objects/bcotool#28 · 1 asignado ·
-
enhancement
Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 25/100
-
Calling BCO uses global pythonAbierto
Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 35/100
-
Error Reporting for bco validateAbierto
Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 35/100
-
Scripts for `run_cwl`Abierto
Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 45/100
Todos los issues de biocompute-objects/bcotool
Issues similares
-
intake mcp-intake needs-ac needs-human-review priority:medium
Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 67/100
Ikalus1988/MisakaNet#3848 · 2 comentarios ·
Los mantenedores suelen responder en 1 día
-
Dificultad 1/5 Menos de una hora Aptitud para principiantes 75/100
521xueweihan/HelloGitHub#4105 ·
-
Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 75/100
igormcsouza/bookloud#54 ·
-
Dificultad 1/5 Menos de una hora Aptitud para principiantes 90/100
aws-samples/sample-per-model-bedrock#526 ·
Los mantenedores suelen responder en 1 día
-
Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 78/100
ok-oldking/ok-wuthering-waves#1802 ·
Los mantenedores suelen responder en 2 días