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ZEISS

8 repositorios indexados · Ver en GitHub

libczi
libCZI is an Open Source Cross-Platform C++ library to read and write CZI.

C++ · 73 estrellas
pylibczirw
A simple and easy-to-use Python wrapper for libCZI - a cross-platform C++ library intended for providing read and write access to CZI doc...

Jupyter Notebook · 34 estrellas
czicompress
Reduce the size of existing CZI-documents by converting them to zstd-compressed CZI documents

C# · 24 estrellas
czicheck
Checking CZI Documents

C++ · 9 estrellas
natz-operator
👨‍✈️ An operator to setup NATS accounting

Go · 7 estrellas
acme-dns-azure
ACME client setup based on Certbot for dns-01 challenges via Azure Cloud services

Python · 6 estrellas
LibCZI_NET
.NET integration for libCZI - read and write CZI-files in C#

C# · 3 estrellas
czi-pyramidizer
tool for adding an image-pyramid to a CZI document

C++ · 2 estrellas

Para principiantes Todo

Abierto Todos

Unable to read time series data from CZI file due to Compression Type Invalid Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 48/100

ZEISS/pylibczirw#128 · Abierto el 21/8/2026
binaries not found Abierto

bug

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 55/100

ZEISS/czicompress#111 · Abierto el 19/8/2026
single-source-of-truth for CZICheck-version and vcpkg-version Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 52/100

ZEISS/czicheck#50 · Abierto el 19/5/2026
CMake removal from requirements Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 50/100

ZEISS/pylibczirw#124 · Abierto el 12/5/2026
czmbi support Abierto

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 35/100

ZEISS/libczi#165 · 2 comentarios · Abierto el 30/4/2026
update Megalinter Abierto

Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 68/100

ZEISS/czi-pyramidizer#7 · Abierto el 21/4/2026
Modernize and Simplify Build Pipeline Abierto

enhancement

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 25/100

ZEISS/pylibczirw#122 · Abierto el 30/3/2026
Add support for Python 3.14 for Windows, UNIX and MacOS Abierto

enhancement

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 48/100

ZEISS/pylibczirw#119 · 4 comentarios · 1 reacción · Abierto el 11/3/2026
[CI/CD] Add UTF8 validation for API.md in PR Abierto

enhancement

Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 45/100

ZEISS/pylibczirw#117 · Abierto el 10/3/2026
extend functionality for "constructing/authoring metadata" for writing CZI Abierto

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 25/100

ZEISS/LibCZI_NET#21 · 2 comentarios · Abierto el 18/2/2026
Mapping for libczi's lossy compression is missing. we only support lossless Abierto

bug

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 42/100

ZEISS/pylibczirw#115 · 1 reacción · Abierto el 5/2/2026
Metadata entry for ComponentBitCount is not created when wring CZI files Abierto

bug

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100

ZEISS/pylibczirw#113 · 1 comentario · Abierto el 22/1/2026
extend stream-mechanism for "get filesize" Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100

ZEISS/libczi#162 · Abierto el 9/1/2026
how to read planes from a split czi file? Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100

ZEISS/libczi#161 · 2 comentarios · Abierto el 7/1/2026
Check for "C dimension present" Abierto

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 45/100

ZEISS/czicheck#42 · 1 reacción · Abierto el 10/12/2025
improve memory requirements Abierto

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 25/100

ZEISS/czi-pyramidizer#4 · Abierto el 5/12/2025
implement in-place operation Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100

ZEISS/czi-pyramidizer#3 · Abierto el 5/12/2025
leverage tile-caching Abierto

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 25/100

ZEISS/czi-pyramidizer#2 · Abierto el 5/12/2025
add mask-support Abierto

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 25/100

ZEISS/czi-pyramidizer#1 · Abierto el 5/12/2025
How to actually use this product? Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100

ZEISS/natz-operator#198 · Abierto el 26/11/2025
apply edits to metadata from existing czi for correlative microscopy Abierto

enhancement

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100

ZEISS/pylibczirw#104 · Abierto el 23/10/2025
publish symbols to Nuget Abierto

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 45/100

ZEISS/LibCZI_NET#16 · Abierto el 7/10/2025
CZIs created with "ICziWriter" (in "proper & default way") should pass CZICheck Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100

ZEISS/libczi#156 · Abierto el 24/9/2025
Support for missing sub-blocks in Apotome czi images Abierto

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 45/100

ZEISS/czicheck#37 · 1 comentario · Abierto el 2/9/2025
CZIcmd: misleading error message Abierto

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 45/100

ZEISS/libczi#152 · Abierto el 28/8/2025
Be able to access subblock metadata Abierto

enhancement

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100

ZEISS/pylibczirw#80 · 3 comentarios · Abierto el 27/5/2025
Enable CZICheck tool to decode data Abierto

enhancement

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 25/100

ZEISS/czicheck#33 · 1 comentario · Abierto el 12/5/2025
Add check if user writes CZI with invalid scaling values (<= 0.0) Abierto

enhancement

Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 38/100

ZEISS/pylibczirw#78 · Abierto el 12/5/2025
Proposal: add a checker for checking "ref-Ids" in XML-metadata Abierto

enhancement

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 25/100

ZEISS/pylibczirw#77 · Abierto el 12/5/2025
Modify CZI Pixeldata in place or inside a cloned CZI file using Python Abierto

enhancement

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 20/100

ZEISS/pylibczirw#76 · Abierto el 12/5/2025
Remove CHANGELOG Abierto

documentation

Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 48/100

ZEISS/pylibczirw#72 · Abierto el 11/4/2025
report issues which can be "ignored" with command-line options Abierto

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 25/100

ZEISS/czicheck#32 · 2 comentarios · Abierto el 20/3/2025
checker for consistency between subblock-directory-information and subblock-segment Abierto

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 30/100

ZEISS/czicheck#30 · Abierto el 1/3/2025
Allow to write additional CZI dimensions like H etc. Abierto

enhancement

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100

ZEISS/pylibczirw#58 · Abierto el 25/2/2025
Read CZI image data from a existing pyramid level Abierto

enhancement

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100

ZEISS/pylibczirw#53 · 1 reacción · Abierto el 16/12/2024
checker for "unsupported compression-method used" (unsupported by libCZI) Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100

ZEISS/czicheck#27 · Abierto el 9/12/2024
checker for "pyramid" Abierto

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 35/100

ZEISS/czicheck#26 · Abierto el 9/12/2024
CziCheck should be able to verify that channel metadata is correctly present in either Dimension/Channels or at least DisplaySettings Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 38/100

ZEISS/czicheck#25 · Abierto el 13/11/2024
Allow to read and write the stage XYZ center coordinates when reading and writing a CZI Abierto

enhancement

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100

ZEISS/pylibczirw#51 · Abierto el 8/11/2024
Create an image pyramid when writing a CZI using pylibCZIrw Abierto

enhancement

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 22/100

ZEISS/pylibczirw#50 · 2 reacciones · Abierto el 8/11/2024
Support the specification of the certbot working directory Abierto

enhancement

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100

ZEISS/acme-dns-azure#136 · Abierto el 12/9/2024
Only upload ACME account configuration to Azure KeyVault if required Abierto

enhancement

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 45/100

ZEISS/acme-dns-azure#135 · Abierto el 12/9/2024
Access CZI "attachments" (i.e. slide label image, slide / tissue preview, etc.) Abierto

enhancement

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100

ZEISS/pylibczirw#38 · 3 comentarios · Abierto el 27/8/2024
Request for Access to Individual Tiles in Mosaic Acquisitions - subblock access Abierto

enhancement

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 30/100

ZEISS/pylibczirw#36 · 2 comentarios · Abierto el 23/8/2024
extended check for "XML-metadata validity" Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 42/100

ZEISS/czicheck#18 · Abierto el 13/8/2024
Adopt PEP517 / pyproject.toml Abierto

bug

Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 52/100

ZEISS/pylibczirw#29 · 2 comentarios · Abierto el 27/7/2024
Load CZI file using pylibczirw and fsspec Abierto

enhancement

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 25/100

ZEISS/pylibczirw#18 · Abierto el 25/7/2024
Create Python Wrapper for czicheck in order to automate checking CZIs from python directly Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100

ZEISS/czicheck#13 · Abierto el 14/6/2024
CSingleChannelTileAccessor::Get() returns uninitialized memory Abierto

ZEISS/libczi#93 · 1 asignado · Abierto el 3/1/2024
checker which validates the consistency of the redundant information in subblock-directory vs subblock-segment Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 45/100

ZEISS/czicheck#6 · Abierto el 8/12/2023

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