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ReproNim

9 repositorios indexados · Ver en GitHub

neurodocker
Generate custom Docker and Singularity images, and minimize existing containers

Python · 361 estrellas
containers
Containers "distribution" for reproducible neuroimaging

Python · 32 estrellas
reproman
ReproMan (AKA NICEMAN, AKA ReproNim TRD3)

Python · 24 estrellas
reprostim
Automated capture of audio-visual stimuli into BIDS datasets

Python · 8 estrellas
ReproInventory
A repo for developing the ReproNim inventory of training resources.

TypeScript · 6 estrellas
OpenNeuroDerivatives-NIDM

Dockerfile · 1 estrella
simple2_bidsapp_babs
test freesurfer_bidsapp with babs

Shell · 1 estrella
freesurfer-nidm_bidsapp
A BIDS App implementation for FreeSurfer that provides standardized surface reconstruction and morphometric analysis with NIDM output.

Python · 0 estrellas
repronim.org
website for repronim.org: A Center for Reproducible Neuroimaging Computation

HTML · 0 estrellas

Para principiantes Todo

Abierto Todos

tune _parse_scan_metadata to prefer 'duration' field from _scans.tsv when present Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100

ReproNim/reprostim#281 · Abierto el 18/9/2026
Add "bindpaths" configuration Abierto

ReproNim/containers#171 · 1 asignado · Abierto el 14/9/2026
download_url gives no retry and a confusing, redundantly-nested error on large-file IncompleteRead/connection-reset failures Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 45/100

ReproNim/containers#169 · Abierto el 14/9/2026
No BABS derivative has dataset_description.json at its root Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 58/100

ReproNim/simple2_bidsapp_babs#12 · 1 comentario · Abierto el 28/8/2026
BEP028 support! Abierto

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 25/100

ReproNim/reprostim#277 · Abierto el 26/8/2026
bids-qr-inject to add mode to inject QR codes into BIDS Abierto

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 35/100

ReproNim/reprostim#275 · Abierto el 26/8/2026
CI: singularity build hangs on GH-hosted runners (unprivileged user namespace restriction) Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 45/100

ReproNim/freesurfer-nidm_bidsapp#12 · Abierto el 26/8/2026
Neurodocker site error Abierto

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 25/100

ReproNim/repronim.org#489 · Abierto el 6/8/2026
Update Collaborator page with new collaboration projects for Phase 3 Abierto

Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 42/100

ReproNim/repronim.org#488 · Abierto el 4/8/2026
Hard-coded apt dependencies in templates break on Debian Bullseye+ Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 48/100

ReproNim/neurodocker#728 · Abierto el 4/8/2026
as of 1.11.0.423 might still be trying to kill whenever not starting the code/reprostim-timesync-stimuli Abierto

ReproNim/reprostim#269 · 1 asignado · Abierto el 31/7/2026
Prepare ReproStim Webinar Abierto

ReproNim/reprostim#265 · 2 asignados · Abierto el 22/7/2026
Update DMSP NIH documents Abierto

ReproNim/repronim.org#481 · 3 comentarios · 2 asignados · Abierto el 22/7/2026
Test/integrate(?) with "encoding-helper" Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100

ReproNim/reprostim#261 · Abierto el 17/7/2026
NIDM extraction: 51/219 datasets failed in the 2025-05-16 run Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 38/100

ReproNim/OpenNeuroDerivatives-NIDM#7 · Abierto el 14/7/2026
More resources, from me to you! Abierto

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 25/100

ReproNim/ReproInventory#44 · Abierto el 11/6/2026
Consider adding "Infrastructure" Abierto

Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 50/100

ReproNim/repronim.org#477 · Abierto el 2/6/2026
Give "Additional asscociated tools" its own page Abierto

Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 68/100

ReproNim/repronim.org#476 · Abierto el 2/6/2026
Add sample ReproNIm acknowledgement statement for authors/collaborators somewhere Abierto

Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 65/100

ReproNim/repronim.org#474 · Abierto el 1/6/2026
Incorporate STAMPED into ReproNim principles Abierto

ReproNim/repronim.org#472 · 1 asignado · Abierto el 28/5/2026
Add bats smoke tests for wrapper-script argument parsing Abierto

Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 85/100

ReproNim/simple2_bidsapp_babs#7 · Abierto el 14/5/2026
Update reproiner from bookworm to trixie Abierto

blocked

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 32/100

ReproNim/reprostim#247 · 1 comentario · Abierto el 5/5/2026
Check/fixup/extend support for building from other docker registries Abierto

ReproNim/containers#160 · 1 reacción · 2 asignados · Abierto el 23/4/2026
Add material: test course Abierto

new-material

Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 55/100

ReproNim/ReproInventory#37 · Abierto el 23/4/2026
Possible Questions for FAQ sheet - Abierto

needs-discussion

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 42/100

ReproNim/repronim.org#466 · 2 comentarios · Abierto el 14/4/2026
Adjust code/reprostim-videocapture-cron to use container Abierto

ReproNim/reprostim#237 · 2 comentarios · 1 asignado · Abierto el 25/3/2026
Links to other Reproducibility Initiatives Abierto

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 35/100

ReproNim/repronim.org#457 · 6 comentarios · Abierto el 3/3/2026
Add the ReproNim chatbot Abierto

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 25/100

ReproNim/repronim.org#456 · Abierto el 3/3/2026
Accept or Reject updates re: Claude ? Abierto

needs-discussion

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 15/100

ReproNim/repronim.org#455 · 14 comentarios · Abierto el 2/3/2026
DataLad page inaccurate Abierto

Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 45/100

ReproNim/repronim.org#453 · Abierto el 23/2/2026
Update licenses info in source files to be up to date Abierto

ReproNim/reprostim#226 · 8 comentarios · 1 asignado · Abierto el 23/2/2026
reprostim-screencapture experiences and desired options Abierto

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 25/100

ReproNim/reprostim#221 · Abierto el 14/1/2026
Consider adding page: How to mitigate risks of using AI Abierto

needs-discussion

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 30/100

ReproNim/repronim.org#448 · Abierto el 8/1/2026
Updating readme Abierto

ReproNim/simple2_bidsapp_babs#2 · 1 asignado · Abierto el 8/1/2026
slow download through git-annex from datasets.datalad.org Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 30/100

ReproNim/containers#155 · Abierto el 30/12/2025
Add publication for NiPoppy Abierto

ReproNim/repronim.org#442 · 1 asignado · Abierto el 19/12/2025
Webinar page refinement Abierto

needs-discussion

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 25/100

ReproNim/repronim.org#439 · Abierto el 9/12/2025
Consider addition of Geographic map for Fellows Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100

ReproNim/repronim.org#435 · Abierto el 2/12/2025
Restructure documentation following Diátaxis Abierto

documentation

ReproNim/reprostim#206 · 1 asignado · Abierto el 26/11/2025
Establish linkml model for the inventory and establish "full ecosystem of CP7 Metadata tools" Abierto

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 25/100

ReproNim/ReproInventory#18 · Abierto el 6/11/2025
Failing to record when a new (HDMI) capturer is connected Abierto

ReproNim/reprostim#201 · 1 asignado · Abierto el 4/11/2025
Text on tutorials page Abierto

ReproNim/repronim.org#425 · 1 comentario · 1 asignado · Abierto el 21/10/2025
Add NITRC connection Abierto

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 20/100

ReproNim/ReproInventory#17 · Abierto el 15/10/2025
Setup monitoring for reprostim-timesync-stimuli not being ran Abierto

ReproNim/reprostim#194 · 1 asignado · Abierto el 13/10/2025
Fellows Products Abierto

pending content

ReproNim/repronim.org#414 · 2 comentarios · 1 asignado · Abierto el 7/10/2025
Add PR reviewer checklist somewhere Abierto

ReproNim/repronim.org#413 · 1 comentario · 1 asignado · Abierto el 7/10/2025
Update tutorial links on NIDM with the tutorials on annotating Freesurfer and FSL Abierto

ReproNim/repronim.org#407 · 1 asignado · Abierto el 30/9/2025
Neurodocker tutorial enhancement Abierto

ReproNim/repronim.org#399 · 1 comentario · 1 reacción · 1 asignado · Abierto el 12/9/2025
Anti-pattern global state mutation with reproman.cfg Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100

ReproNim/reproman#639 · Abierto el 11/9/2025
Remove setup_requires to avoid deprecation warning on RTD builds (could break October 25) Abierto

documentation

Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 48/100

ReproNim/reproman#638 · 2 comentarios · Abierto el 11/9/2025

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