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Stack overflow in Spring & SFDP layouts

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Evaluación

Dificultad
4/5
Tiempo estimado
3-5 días
Aptitud para principiantes
35/100
Tipo de issue
Error
Claridad
Bastante claro
Estado de actividad
Estancado
Stack tecnológico
julia

Línea de trabajo

Empieza reproduciendo los datos adjuntos con las llamadas a NetworkLayout.sfdp y NetworkLayout.spring mostradas en el issue, incluidos los argumentos del diseño parcial. Rastrea dónde se produce el StackOverflowError y compara el comportamiento de las variantes del grafo dirigido y no dirigido; se considera terminado cuando ambos diseños manejan esta entrada sin desbordar la pila.

Escrito por el modelo de indexación a partir del texto del issue.

Descripción

I have some somewhat-large graph data that I'm attempting to do partial layouts on, and I'm hitting StackOverflowErrors when I try. I'm attaching the data, and here's the code I'm using for layout:

using GraphIO.EdgeList, Graphs
using NetworkLayout
using GeometryBasics: Point
using JSON3


println("Loading data")
g = loadgraph("graph.e", EdgeListFormat())
pin = identity.(JSON3.read("pin.json"))
initialpos = identity.(JSON3.read("initialpos.json"))


println("Running layout")
# Both of the following fail
NetworkLayout.sfdp(g; pin, initialpos, iterations = 5)
NetworkLayout.spring(g; pin, initialpos, initialtemp = 3.940695496278636, iterations = 5)

data.tgz

Any thoughts? I did also try converting g to an undirected graph, but that doesn't seem to make any difference.

Lenguaje dominante
Julia
Estrellas
109
Forks
26
Merge medio
2 d 8 h
PR fusionados (30 d)
3

Preparar el entorno

Este proyecto no incluye contenedor de desarrollo, Dockerfile ni guía de contribución, así que la configuración corre por tu cuenta: empieza por su README y consulta nuestra guía para la primera contribución para los pasos generales.

Primeros pasos

  1. Lee el issue completo y luego la guía de contribución del proyecto.
  2. Comenta en el issue que vas a ocuparte — evita que dos personas hagan lo mismo.
  3. Haz un fork del repositorio y trabaja en una rama.
  4. Abre un pull request que haga referencia al número del issue.

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