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Add processing tools for exclusion sets (as methods)

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@vimar-gu ya está trabajando en esto.

Desde el 22/4/2025.

Evaluación

Este issue todavía no se ha evaluado.

Descripción

structure

This is for test-set filtering, removal of human faces, removal of images of labels (vs. specimens), removal of empty camera trap frames (from GBIF), general cleaning for citizen science data (remove cluttered occurrences and set camera traps to proper processing), etc. in more detail...

  • All lookup table exclude creators from TreeOfLife-dev (many of these are here) should be in src/ for this repo:
    • PDQ hash process
    • Image type separator (museum, camera trap, and citizen science categories)
    • Museum Specimen processing: label vs specimen filter
    • camera trap processing: megadetector & reducer
    • citizen science image processing
    • face detection
  • Add slurm scripts that run these processes from TreeOfLife-dev to root-level scripts/ directory (these will be more template (your/path/here) style.

This whole process then also needs clear documentation for how to use each of these tools and the pipeline.

Lenguaje dominante
Jupyter Notebook
Estrellas
7
Forks
1
Métricas de merge de PR
Sin PR fusionados en 30 d

Preparar el entorno

Este proyecto no incluye contenedor de desarrollo, Dockerfile ni guía de contribución, así que la configuración corre por tu cuenta: empieza por su README y consulta nuestra guía para la primera contribución para los pasos generales.

Primeros pasos

  1. Lee el issue completo y luego la guía de contribución del proyecto.
  2. Comenta en el issue que vas a ocuparte — evita que dos personas hagan lo mismo.
  3. Haz un fork del repositorio y trabaja en una rama.
  4. Abre un pull request que haga referencia al número del issue.

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