HenriquesLab/ZeroCostDL4Mic

Las issues en las que quizá ya trabaja alguien aparecen al final. Ordenar todo por fecha

• Quality Control notebook Install dependencies error

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  Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 32/100

  HenriquesLab/ZeroCostDL4Mic#351 · Abierto el 12/8/2025

• Deep-STORM_2D_ZeroCostDL4Mic

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  HenriquesLab/ZeroCostDL4Mic#350 · Abierto el 18/7/2025

• ImportError: numpy.core.multiarray failed to import` / `AttributeError: _ARRAY_API not found` when importing stardist

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  HenriquesLab/ZeroCostDL4Mic#348 · 1 comentario · Abierto el 4/6/2025

• StarDist_2D Load key dependencies issue

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  HenriquesLab/ZeroCostDL4Mic#347 · 1 comentario · Abierto el 30/4/2025

• ImportError: multi.core.array failed to import

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  HenriquesLab/ZeroCostDL4Mic#346 · 2 comentarios · Abierto el 31/3/2025

• UNET 3D,old model can not use in new version

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  HenriquesLab/ZeroCostDL4Mic#345 · 1 comentario · Abierto el 28/3/2025

• ImportError: `imsave` Removed from `tifffile` – Update Notebook to Use `imwrite`

  Quizá libre de nuevo @mariana-gferreira la tomó hace 565 días y no hay ningún pull request abierto. Abierto

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  HenriquesLab/ZeroCostDL4Mic#343 · 1 comentario · 1 asignado · Abierto el 5/3/2025

• DEEPSTORM GOOGLE COLAB - issue with training the model

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  HenriquesLab/ZeroCostDL4Mic#342 · Abierto el 11/2/2025

• StarDist2D path issue: models are not stored in the user defined location

  Quizá libre de nuevo @esgomezm la tomó hace 565 días y no hay ningún pull request abierto. Abierto

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  HenriquesLab/ZeroCostDL4Mic#340 · 2 comentarios · 1 asignado · Abierto el 27/1/2025

• StarDist_3D_ZeroCostDL4Mic notebook issue installing dependencies

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  HenriquesLab/ZeroCostDL4Mic#337 · 1 comentario · Abierto el 8/11/2024

• Splinedist failing to install dependencies

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  HenriquesLab/ZeroCostDL4Mic#328 · Abierto el 24/9/2024

• Failed to train UNET

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  HenriquesLab/ZeroCostDL4Mic#324 · 7 comentarios · Abierto el 26/8/2024

• fnet_3D | Failed to build scikit-learn

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  HenriquesLab/ZeroCostDL4Mic#323 · Abierto el 9/8/2024

• Cellpose - two models not found

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  HenriquesLab/ZeroCostDL4Mic#321 · 1 comentario · Abierto el 29/7/2024

• issue with stardist2D prediction progresss

  Quizá libre de nuevo @IvanHCenalmor la tomó hace 821 días y no hay ningún pull request abierto. Abierto

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  HenriquesLab/ZeroCostDL4Mic#318 · 1 comentario · 1 asignado · Abierto el 16/4/2024

• Where to find the requirement file to create a local env

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  HenriquesLab/ZeroCostDL4Mic#316 · 1 comentario · Abierto el 8/4/2024

• Cellpose 2 - Evaluate your model and generate predictions issues

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  HenriquesLab/ZeroCostDL4Mic#314 · Abierto el 31/3/2024

• Issue saving simulated data in Deep-STORM notebook.

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  HenriquesLab/ZeroCostDL4Mic#311 · Abierto el 23/2/2024

• EmpedSeg: requested version for torch and torchvision not found, with different versions type error while training

  Quizá libre de nuevo @esgomezm la tomó hace 1012 días y no hay ningún pull request abierto. Abierto

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  bug dependencies

  HenriquesLab/ZeroCostDL4Mic#306 · 2 comentarios · 1 asignado · Abierto el 17/1/2024

• 3D unet: Problem with Section 5.4, cannot download model as bioImage

  Quizá libre de nuevo @mariana-gferreira la tomó hace 1108 días y no hay ningún pull request abierto. Abierto

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  HenriquesLab/ZeroCostDL4Mic#288 · 8 comentarios · 1 asignado · Abierto el 29/8/2023

• ModuleNotFoundError: No module named 'splinegenerator'

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  HenriquesLab/ZeroCostDL4Mic#273 · 3 comentarios · Abierto el 5/6/2023

• [Feature] Full notebook CI testing

  Quizá libre de nuevo @ctr26 la tomó hace 1241 días y no hay ningún pull request abierto. Abierto

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  HenriquesLab/ZeroCostDL4Mic#271 · 2 comentarios · 1 asignado · Abierto el 2/6/2023

• Unable to use the TF_SavedModel in Stardist 2D plugin in Fiji

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  HenriquesLab/ZeroCostDL4Mic#269 · 2 comentarios · Abierto el 2/6/2023

• 2D Stardist keeps crashing when Generating prediction(s) from unseen dataset

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  HenriquesLab/ZeroCostDL4Mic#265 · 1 comentario · Abierto el 4/5/2023

• Stardist 2D prediction error output , 1000*1000 with 16bit

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  HenriquesLab/ZeroCostDL4Mic#257 · 1 comentario · Abierto el 1/4/2023

• Error in 1.3. Load key dependencies StarDist_2D

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  HenriquesLab/ZeroCostDL4Mic#249 · 10 comentarios · Abierto el 14/3/2023

• YOLOv2 section 1.3 tensorflow

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  HenriquesLab/ZeroCostDL4Mic#246 · 2 comentarios · 1 reacción · Abierto el 27/2/2023

• Stardist error message when running multiple images in google drive

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  HenriquesLab/ZeroCostDL4Mic#237 · 1 comentario · Abierto el 2/2/2023

• StarDist_3D image artifact issue

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  HenriquesLab/ZeroCostDL4Mic#235 · 7 comentarios · Abierto el 12/1/2023

• Training issues

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  HenriquesLab/ZeroCostDL4Mic#218 · 5 comentarios · Abierto el 27/10/2022

• Training failed after data augmentation

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  HenriquesLab/ZeroCostDL4Mic#215 · 5 comentarios · Abierto el 14/10/2022

• DFCAN 3D

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  Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 25/100

  HenriquesLab/ZeroCostDL4Mic#209 · 3 comentarios · Abierto el 10/9/2022

• Yolov2 fails at 1.3

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  HenriquesLab/ZeroCostDL4Mic#208 · 1 comentario · 1 reacción · Abierto el 8/9/2022

• Label-free prediction (fnet) 2D error when setting training parameters

  Quizá libre de nuevo @IvanHCenalmor la tomó hace 821 días y no hay ningún pull request abierto. Abierto

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  HenriquesLab/ZeroCostDL4Mic#192 · 6 comentarios · 1 asignado · Abierto el 19/5/2022

• YOLOv2 Step 6 fails with error ValueError: axes don't match array

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  HenriquesLab/ZeroCostDL4Mic#186 · 1 reacción · Abierto el 22/4/2022

• How to convert annotation - json format to pascal voc xml file for YoloV2

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  HenriquesLab/ZeroCostDL4Mic#182 · 6 comentarios · Abierto el 25/3/2022

• Cellpose training

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  HenriquesLab/ZeroCostDL4Mic#179 · 10 comentarios · Abierto el 11/3/2022

• Mask RCNN model shape error while generating prediction from unseen dataset

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  HenriquesLab/ZeroCostDL4Mic#176 · 1 comentario · Abierto el 7/3/2022

• Running the script on a local runtime produces errors in loading key dependencies

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  HenriquesLab/ZeroCostDL4Mic#171 · 2 comentarios · Abierto el 22/2/2022

• In Stardist2D number_of_steps is calculated assuming all training data has the same size

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  HenriquesLab/ZeroCostDL4Mic#167 · 2 comentarios · Abierto el 9/2/2022

• Error: StarDist_2D keeps disconnecting runtime in the middle of the run

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  HenriquesLab/ZeroCostDL4Mic#166 · 1 comentario · Abierto el 4/2/2022

• Error when creating data sets, issues when training large images and prediction output format

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  HenriquesLab/ZeroCostDL4Mic#156 · 3 comentarios · Abierto el 28/11/2021

• YOLOv2 notebook local error - section 4.1

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  HenriquesLab/ZeroCostDL4Mic#152 · 1 comentario · Abierto el 8/11/2021

• Invalid distribution --Stardist (-tardist)

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  HenriquesLab/ZeroCostDL4Mic#145 · Abierto el 18/10/2021

• StarDist notebook local error

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  Dificultad 1/5 Menos de una hora Aptitud para principiantes 55/100

  HenriquesLab/ZeroCostDL4Mic#144 · 1 comentario · Abierto el 18/10/2021

• U-Net 2D Quality Control Error with .png test images

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  Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 35/100

  HenriquesLab/ZeroCostDL4Mic#143 · 3 comentarios · Abierto el 12/10/2021

• Training models to identify multiple organelles with 3D UNET

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  Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 25/100

  HenriquesLab/ZeroCostDL4Mic#142 · 2 comentarios · Abierto el 11/10/2021

• Crash when trying to run RetinaNet

  Quizá libre de nuevo @iarganda la tomó hace 1867 días y no hay ningún pull request abierto. Abierto

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  HenriquesLab/ZeroCostDL4Mic#140 · 7 comentarios · 1 asignado · Abierto el 6/9/2021

• Errors when running YOLO notebook while connected to a local runtime

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  Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 30/100

  HenriquesLab/ZeroCostDL4Mic#139 · 4 comentarios · Abierto el 2/9/2021

• .h5 file format for 3D UNET

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  Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 35/100

  HenriquesLab/ZeroCostDL4Mic#116 · 1 comentario · Abierto el 6/7/2021