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Adaptive Time Stepping package error loading from toml

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Evaluación

Dificultad
2/5
Tiempo estimado
1-3 horas
Aptitud para principiantes
72/100
Tipo de issue
Error
Claridad
Bien especificado
Estado de actividad
Activo
Stack tecnológico
python
Área
backend

Línea de trabajo

El fallo está en imod/mf6/simulation.py en Modflow6Simulation.from_file, donde la clave de sección de TOML se busca en un mapeo classes y falta AdaptiveTimeStepping. Reprodúcelo volcando un modelo que contiene un paquete ats y cargándolo de nuevo con from_file, y luego inspecciona cómo se registran y reconstruyen otros paquetes desde TOML. Hecho significa que un TOML que contiene [AdaptiveTimeStepping] se carga correctamente y las pruebas de simulación relevantes siguen pasando.

Escrito por el modelo de indexación a partir del texto del issue.

Descripción

bug Deltares

Bug description
imod.mf6.Modflow6Simulation.from_file(model_toml) fails when an ats (adaptive time stepping) package is present in the model, that is written to netcdf files using model.dump('folder/to/dump')

Steps to reproduce
Error message:

KeyError Traceback (most recent call last)
Cell In[4], line 1
----> 1 model = imod.mf6.Modflow6Simulation.from_file(model_toml)

File c:\model_builder.pixi\envs\default\Lib\site-packages\imod\logging\logging_decorators.py:32, in standard_log_decorator..decorator..wrapper(*args, **kwargs)
29 logger.log(loglevel=start_level, message=start_message, additional_depth=2)
31 # run function
---> 32 return_value = fun(*args, **kwargs)
33 end_time = time()
35 # anounce end of function

File c:\model_builder.pixi\envs\default\Lib\site-packages\imod\mf6\simulation.py:1126, in Modflow6Simulation.from_file(toml_path)
1124 for key, entry in toml_content.items():
1125 if key not in ["gwtgwf_exchanges", "split_exchanges"]:
-> 1126 item_cls = classes[key]
1127 for name, filename in entry.items():
1128 path = toml_path.parent / filename

KeyError: 'AdaptiveTimeStepping'

Desktop (please complete the following information):

  • iMOD Python Version '1.0.0.post1'

Additional context
In this case I want to load an existing model, use the spatial information and make additional changes for scenario development. This is now not automatically possible, as I can not simply load the data using the toml. The manual workaround is to remove the [AdaptiveTimeStepping] section from the toml manually, so i can at least load the other packages.

Lenguaje dominante
Python
Estrellas
41
Forks
10
Merge medio
2 d 23 h
PR fusionados (30 d)
15

Preparar el entorno

  • Sin Dockerfile ni archivo de Docker Compose
  • Tiene una plantilla de pull request
  • Sin guía de contribución

Primeros pasos

  1. Lee el issue completo y luego la guía de contribución del proyecto.
  2. Comenta en el issue que vas a ocuparte — evita que dos personas hagan lo mismo.
  3. Haz un fork del repositorio y trabaja en una rama.
  4. Abre un pull request que haga referencia al número del issue.

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