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["model"] Check impact of latent period delay from infectious to hospitalized on model dynamics and forecasts

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@PhilMiller ya está trabajando en esto.

Desde el 29/3/2020.

Evaluación

Este issue todavía no se ha evaluado.

Descripción

models
Summary

There's no a priori reason to assume that transition of a person from the Susceptible to Infectious states corresponds with immediate development of symptoms requiring hospitalization. If there's a separation in time, then the model may be mis-predicting spread in the region by initializing I based on present-day hospitalizations.

We need to check whether accounting for this affects relevant forecast outputs.

Additional details
Suggested fix

Shift the initialization from current hospitalizations to community infection rate back in time by a configurable latent_period, and then shift forecast admissions of newly-infected individuals forward in time by that same latent_period

Lenguaje dominante
Python
Estrellas
210
Forks
153
Sin PR fusionados en 30 d

Guía de contribución

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Primeros pasos

  1. Lee el issue completo y luego la guía de contribución del proyecto.
  2. Comenta en el issue que vas a ocuparte — evita que dos personas hagan lo mismo.
  3. Haz un fork del repositorio y trabaja en una rama.
  4. Abre un pull request que haga referencia al número del issue.

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