Bioconductor/SummarizedExperiment

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A container (S4 class) for matrix-like assays

Estrellas: 39
Forks: 11
Issues abiertos para principiantes: 1
Issues indexados: 29

Lenguaje dominante: R
Licencia: Sin datos de licencia
Último push a GitHub: 28/4/2026
Última indexación: 21/9/2026
Guía de contribución: Sin guía de contribución
Código de conducta: Sin código de conducta
Etiquetas para principiantes: Sin etiquetas para principiantes indexadas
Métricas de merge de PR: Sin PR fusionados en 30 d

Para principiantes Todo

Abierto Todos

combineCols Exponential Slowdown Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 55/100

Bioconductor/SummarizedExperiment#99 · Abierto el 10/9/2026
Adding a new assay forces dimnames on all existing assays Abierto

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 68/100

Bioconductor/SummarizedExperiment#96 · Abierto el 4/8/2026
Adding data to row/colData Abierto

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 35/100

Bioconductor/SummarizedExperiment#92 · 3 comentarios · Abierto el 26/1/2026
Replacing colData with a named DataFrame silently misaligns assay columns when row order differs Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 45/100

Bioconductor/SummarizedExperiment#91 · Abierto el 9/1/2026
Subsetting SE with factor() does not work Abierto

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 45/100

Bioconductor/SummarizedExperiment#89 · 1 comentario · Abierto el 1/9/2025
SE and RangeSE (and SCE) differences in accessing rowData Abierto

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 25/100

Bioconductor/SummarizedExperiment#86 · 1 reacción · Abierto el 8/3/2025
longForm,SummarizedExperiment Abierto

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 25/100

Bioconductor/SummarizedExperiment#85 · 3 comentarios · Abierto el 26/1/2025
`RangedSummarizedExperiment` cannot be stored in a `SummarizedExperiment`-only slot Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100

Bioconductor/SummarizedExperiment#84 · 1 comentario · Abierto el 31/10/2024
n x p Abierto

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 15/100

Bioconductor/SummarizedExperiment#82 · 1 comentario · Abierto el 11/9/2024
Coercion from SCE drops off rowData Abierto

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 42/100

Bioconductor/SummarizedExperiment#81 · 3 comentarios · Abierto el 30/7/2024
Warning about dim, nrow and ncol deprecated methods. Abierto

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 35/100

Bioconductor/SummarizedExperiment#74 · 2 comentarios · Abierto el 26/6/2023
colData Default in Constructor Inconsistency Abierto

Bioconductor/SummarizedExperiment#73 · 1 comentario · 1 asignado · Abierto el 18/5/2023
Add an `assaybind()` method Abierto

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 35/100

Bioconductor/SummarizedExperiment#69 · Abierto el 16/1/2023
package(s) not installed when version(s) same as or greater than current; use `force = TRUE` to re-install: 'SummarizedExperiment' Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 20/100

Bioconductor/SummarizedExperiment#68 · 1 comentario · Abierto el 10/1/2023
Erroneous behaviour when colData is data.frame Abierto

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 45/100

Bioconductor/SummarizedExperiment#67 · Abierto el 29/11/2022
`combineCols` should keep names in metadata with `use.names=TRUE` Abierto

Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 68/100

Bioconductor/SummarizedExperiment#66 · Abierto el 4/11/2022
Enforce unique assay names Abierto

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 25/100

Bioconductor/SummarizedExperiment#60 · 2 comentarios · Abierto el 18/1/2022
Should the show() method for SummarizedExperiment objects suggest saveHDF5SummarizedExperiment()? Abierto

enhancement

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 25/100

Bioconductor/SummarizedExperiment#59 · 1 comentario · Abierto el 7/10/2021
Add rownames check for cbind() Abierto

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 52/100

Bioconductor/SummarizedExperiment#53 · 1 reacción · Abierto el 30/7/2021
More informative error message for mismatching numbers of rows Abierto

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 45/100

Bioconductor/SummarizedExperiment#46 · Abierto el 19/10/2020
loading package taking too much memory Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 25/100

Bioconductor/SummarizedExperiment#44 · 2 comentarios · Abierto el 27/8/2020
colData assignment should fail but does not Abierto

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 35/100

Bioconductor/SummarizedExperiment#36 · 1 comentario · Abierto el 14/2/2020
Slightly relaxing the rowData checks for cbind Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100

Bioconductor/SummarizedExperiment#33 · Abierto el 28/11/2019
Should `rowData` be merged with `mcols(gr)`? Abierto

question

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 30/100

Bioconductor/SummarizedExperiment#30 · 2 comentarios · Abierto el 25/7/2019
derived RSE to SE coercion discards names Abierto

Bioconductor/SummarizedExperiment#29 · 15 comentarios · 1 asignado · Abierto el 23/7/2019
c() does not work on SummarizedExperiment Abierto

Bioconductor/SummarizedExperiment#27 · 1 comentario · 2 reacciones · 1 asignado · Abierto el 18/7/2019
SummarizedExperiment::cbind Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100

Bioconductor/SummarizedExperiment#23 · 3 comentarios · 1 reacción · Abierto el 12/6/2019
Implement an all.equal() method for SummarizedExperiment objects that performs a "deep comparison" Abierto

Bioconductor/SummarizedExperiment#22 · 1 asignado · Abierto el 16/5/2019
rowData rownames issue explored at BioC2018 Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100

Bioconductor/SummarizedExperiment#13 · 6 comentarios · 1 reacción · Abierto el 26/7/2018

Bioconductor/SummarizedExperiment

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