Benjamin-Lee

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• absent amino acids

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  Benjamin-Lee/CodonAdaptationIndex#18 · 1 comentario · Abierto el 4/12/2025

• Running error, can you help to see it

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  Benjamin-Lee/vdsearch#16 · 2 comentarios · Abierto el 8/8/2025

• Any advice on how to install vdsearch on Google Colab

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  Benjamin-Lee/vdsearch#15 · 1 comentario · Abierto el 6/5/2024

• Is rnamotif mandatory? how do i complement it to the software?

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  Benjamin-Lee/vdsearch#13 · 1 comentario · Abierto el 9/11/2023

• Installation error: nimporter.NimCompileException: cannot open file: cello

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  Benjamin-Lee/vdsearch#12 · 1 comentario · 1 reacción · Abierto el 4/4/2023

• [Request] Conda installable

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  Benjamin-Lee/vdsearch#8 · 2 comentarios · Abierto el 2/2/2023

• Download CMs when Infernal command needs them and they're not provided or cached

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  Benjamin-Lee/vdsearch#6 · Abierto el 26/2/2022

• Automatically purge the cache on a version update

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  Benjamin-Lee/vdsearch#5 · Abierto el 26/2/2022

• Parallelize find_circs

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  Benjamin-Lee/vdsearch#4 · Abierto el 26/2/2022

• Add a command to predict structures of sequences

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  Benjamin-Lee/vdsearch#3 · Abierto el 26/2/2022

• Enable support for configurable minimum identity and seed length in find_circs

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  Benjamin-Lee/vdsearch#2 · Abierto el 26/2/2022

• Kill the easy-search pipeline if the number of circRNAs is zero

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  Benjamin-Lee/vdsearch#1 · Abierto el 26/2/2022

• pip install not working

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  Benjamin-Lee/CodonAdaptationIndex#14 · 17 comentarios · Abierto el 16/9/2021

• Link out to NCBI GenBank page for each rotationally identical sequence

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  Benjamin-Lee/viroiddb#55 · Abierto el 1/7/2021

• sequence list page - color coding types and more

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  Benjamin-Lee/viroiddb#49 · 1 comentario · Abierto el 30/6/2021

• Add copy/download buttons to Infernal output

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  Benjamin-Lee/viroiddb#48 · Abierto el 30/6/2021

• Unify + and - SS view

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  Benjamin-Lee/viroiddb#42 · Abierto el 29/6/2021

• Add clear results button to search

  Quizá libre de nuevo @CalebOh01 la tomó hace 1916 días y no hay ningún pull request abierto. Abierto

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  Benjamin-Lee/viroiddb#39 · 1 comentario · 1 asignado · Abierto el 28/6/2021

• Sequence viewer flukes

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  Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 20/100

  Benjamin-Lee/viroiddb#21 · 1 comentario · Abierto el 17/6/2021

• Sequence hub flukes

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  Benjamin-Lee/viroiddb#15 · Abierto el 14/6/2021

• Add page with direct data download links

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  Benjamin-Lee/viroiddb#2 · Abierto el 4/6/2021

• Add page listing versions and changes

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  Benjamin-Lee/viroiddb#1 · Abierto el 4/6/2021

• mlf-core: a framework for deterministic machine learning

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  Dificultad 1/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 35/100

  Benjamin-Lee/deep-rules#361 · 1 comentario · Abierto el 14/5/2021

• Conda package

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  Dificultad 1/5 Menos de una hora Aptitud para principiantes 25/100

  Benjamin-Lee/CodonAdaptationIndex#13 · 2 reacciones · Abierto el 5/5/2021

• Method doesn't default to yau

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  Benjamin-Lee/DNAvisualization.org#198 · Abierto el 25/1/2021

• Add a jupyter notebook to docs or tests

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  Benjamin-Lee/CodonAdaptationIndex#11 · 3 comentarios · Abierto el 1/1/2021

• If sequence names are too long, don't show them in the title but do show the legend

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  Benjamin-Lee/DNAvisualization.org#186 · Abierto el 24/12/2020

• Zooming in on a region when there's no sequence there still produces points

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  Benjamin-Lee/DNAvisualization.org#185 · Abierto el 24/12/2020

• Normalize citation formats

  Quizá libre de nuevo @SoumilSingh la tomó hace 2102 días y no hay ningún pull request abierto. Abierto

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  Benjamin-Lee/DNAvisualization.org#184 · 1 asignado · Abierto el 23/12/2020

• Zoom on Gates fails

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  Benjamin-Lee/DNAvisualization.org#176 · Abierto el 19/12/2020

• Showing a spinner breaks updating when zooming in after changing

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  Benjamin-Lee/DNAvisualization.org#175 · Abierto el 19/12/2020

• Only show spinner when there's no precomputed 10k visualization

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  Benjamin-Lee/DNAvisualization.org#173 · Abierto el 18/12/2020

• Close modal appears twice

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  Benjamin-Lee/DNAvisualization.org#170 · 1 comentario · Abierto el 18/12/2020

• Move visualization to a new route

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  Benjamin-Lee/DNAvisualization.org#169 · 1 comentario · Abierto el 18/12/2020

• Delete axios

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  Benjamin-Lee/DNAvisualization.org#161 · 1 asignado · Abierto el 18/12/2020

• Move WASM to a WebWorker

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  enhancement requirement

  Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 20/100

  Benjamin-Lee/DNAvisualization.org#149 · Abierto el 16/12/2020

• Zooming in ignores disabled legend items

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  Benjamin-Lee/DNAvisualization.org#146 · Abierto el 16/12/2020

• Show sequence names on hover in file mode

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  Benjamin-Lee/DNAvisualization.org#145 · Abierto el 16/12/2020

• Show error when file is too large

  Quizá libre de nuevo @Benjamin-Lee la tomó hace 2110 días y no hay ningún pull request abierto. Abierto

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  Benjamin-Lee/DNAvisualization.org#144 · 1 asignado · Abierto el 16/12/2020

• Change the method picker from a b-button-group to a b-radio

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  Benjamin-Lee/DNAvisualization.org#143 · Abierto el 15/12/2020

• Add GC content visualization

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  Benjamin-Lee/DNAvisualization.org#142 · 4 comentarios · Abierto el 15/12/2020

• Add support for changing file uploaded file names

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  Benjamin-Lee/DNAvisualization.org#138 · Abierto el 15/12/2020

• Automatically decide whether to use sequence mode or file mode

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  Benjamin-Lee/DNAvisualization.org#136 · Abierto el 15/12/2020

• Fix leaking WASM memory

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  Benjamin-Lee/DNAvisualization.org#124 · Abierto el 13/12/2020

• Add list of citations

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  Benjamin-Lee/DNAvisualization.org#123 · 1 comentario · 1 asignado · Abierto el 13/12/2020

• Convert Gates, Randic, and Qi to i32

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  Benjamin-Lee/DNAvisualization.org#122 · 1 comentario · Abierto el 13/12/2020

• Fix WASM switch cases to support lowercase

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  Benjamin-Lee/DNAvisualization.org#117 · 1 comentario · Abierto el 12/12/2020

• Make y zooming work

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  Benjamin-Lee/DNAvisualization.org#103 · Abierto el 10/12/2020

• Give specific example of relevant metrics for overfitting

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  Benjamin-Lee/deep-rules#267 · Abierto el 13/10/2020

• Outstanding issues not specific to any tips

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  Benjamin-Lee/deep-rules#252 · 10 comentarios · Abierto el 7/10/2020