sanger-tol/sequencecomposition

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#31 geöffnet am 02.05.2022

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Beschreibung

Description of feature

This is ideally done with RNA-seq data. It is equal to percentage of reads mapped to the genome. Possible software: WGSIM

Contributor Guide

Research-Richtung
Überprüfen Sie die Struktur der Nextflow Pipeline und die vorhandenen Prozessdefinitionen. Untersuchen Sie, wie Sie WGSIM verwenden, um Reads zu simulieren und den Prozentsatz der auf das Genom abgebildeten Reads zu berechnen.
Tech Stack
groovy
Domain
data
Issue Type
Funktion
SchwierigkeitGeschätzte Implementierungsschwierigkeit für neue Contributors, von 1 für sehr kleine Änderungen bis 5 für Expertenarbeit.
3
Geschätzte ZeitEin grober Zeitrahmen, um zu recherchieren, zu implementieren, zu testen und einen Pull Request vorzubereiten.
Halber Tag
AktivitätsstatusWie verfügbar das Issue gerade wirkt: frisch, aktiv, stale, blockiert oder wartet auf Maintainer-Input.
Frisch
KlarheitWie klar das Issue die erwartete Änderung, Akzeptanzkriterien und den nächsten Schritt erklärt.
Meist klar
Voraussetzungen
GitNextflow
EinsteigerfreundlichkeitEin Score von 1 bis 100, der schätzt, wie zugänglich dieses Issue für First-Time Contributors ist.
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