sanger-tol/sequencecomposition

DFAM

Offen

#25 geöffnet am 17.06.2024

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Beschreibung

Copy the functionality from the GDA pipeline.

Essentially, this is running hmmscan across the entire genome.

Contributor Guide

Research-Richtung
Überprüfen Sie die GDA Pipeline, um zu verstehen, wie hmmscan implementiert ist, und integrieren Sie die entsprechende Funktionalität in diese Nextflow Pipeline.
Tech Stack
Keine
Domain
data engineering
Issue Type
Funktion
SchwierigkeitGeschätzte Implementierungsschwierigkeit für neue Contributors, von 1 für sehr kleine Änderungen bis 5 für Expertenarbeit.
3
Geschätzte ZeitEin grober Zeitrahmen, um zu recherchieren, zu implementieren, zu testen und einen Pull Request vorzubereiten.
Halber Tag
AktivitätsstatusWie verfügbar das Issue gerade wirkt: frisch, aktiv, stale, blockiert oder wartet auf Maintainer-Input.
Frisch
KlarheitWie klar das Issue die erwartete Änderung, Akzeptanzkriterien und den nächsten Schritt erklärt.
Meist klar
Voraussetzungen
GitNextflow
EinsteigerfreundlichkeitEin Score von 1 bis 100, der schätzt, wie zugänglich dieses Issue für First-Time Contributors ist.
50