sanger-tol/sequencecomposition

LTR retrotransposons from `LTRdigest`

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#24 geöffnet am 02.06.2024

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Beschreibung

Copy the functionality from the GDA pipeline.

Contributor Guide

Research-Richtung
Untersuchen Sie die GDA Pipeline, um zu sehen, wie sie LTRdigest für LTR Retrotransposons verwendet, und untersuchen Sie dann die vorhandenen Module dieser Pipeline, um die Integration zu planen.
Tech Stack
Keine
Domain
data
Issue Type
Funktion
SchwierigkeitGeschätzte Implementierungsschwierigkeit für neue Contributors, von 1 für sehr kleine Änderungen bis 5 für Expertenarbeit.
3
Geschätzte ZeitEin grober Zeitrahmen, um zu recherchieren, zu implementieren, zu testen und einen Pull Request vorzubereiten.
Halber Tag
AktivitätsstatusWie verfügbar das Issue gerade wirkt: frisch, aktiv, stale, blockiert oder wartet auf Maintainer-Input.
Frisch
KlarheitWie klar das Issue die erwartete Änderung, Akzeptanzkriterien und den nächsten Schritt erklärt.
Meist klar
Voraussetzungen
GitNextflow
EinsteigerfreundlichkeitEin Score von 1 bis 100, der schätzt, wie zugänglich dieses Issue für First-Time Contributors ist.
70