nf-core/pathogensurveillance

Add alternative to `report_group_ids` column that takes column names to base groups on

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#158 geöffnet am 02.04.2025

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Beschreibung

Similar to color_by, there could be a column called report_group_by that takes one or more column names and a report is made for each combination of values in those columns present in the input. This could work along side report_group_ids by converting the report_group_by into IDs and combining the IDs from the two columns.

Contributor Guide

Research-Richtung
Untersuchen Sie, wie die Spalte `report group ids` derzeit implementiert und verarbeitet wird. Erstellen Sie dann einen ähnlichen Mechanismus für `report group by`, der Spaltennamen akzeptiert und entsprechend Gruppierungs IDs generiert.
Tech Stack
groovy
Domain
data
Issue Type
Funktion
SchwierigkeitGeschätzte Implementierungsschwierigkeit für neue Contributors, von 1 für sehr kleine Änderungen bis 5 für Expertenarbeit.
3
Geschätzte ZeitEin grober Zeitrahmen, um zu recherchieren, zu implementieren, zu testen und einen Pull Request vorzubereiten.
1-2 Tage
AktivitätsstatusWie verfügbar das Issue gerade wirkt: frisch, aktiv, stale, blockiert oder wartet auf Maintainer-Input.
Aktiv
KlarheitWie klar das Issue die erwartete Änderung, Akzeptanzkriterien und den nächsten Schritt erklärt.
Klar
Voraussetzungen
GroovyNextflow
EinsteigerfreundlichkeitEin Score von 1 bis 100, der schätzt, wie zugänglich dieses Issue für First-Time Contributors ist.
70