nf-core/deepvariant

Deepvariant Version

Offen

#19 geöffnet am 17.02.2019

Auf GitHub ansehenContributor Guide
 (17 Kommentare) (0 Reaktionen) (0 zugewiesene Personen)Nextflow (26 Forks)auto 404
feature-requestgood first issue

Repository-Metriken

Stars
 (41 Sterne)
PR-Merge-Metriken
 (PR-Metriken ausstehend)

Beschreibung

@ewels Hello,

  1. Could you update the pipeline to 0.72 version?

  2. If i run it locally on my pc, will it use my acceleration cores of my GPU?

Contributor Guide

Research-Richtung
Untersuche, wo die DeepVariant Version in der Nextflow Pipeline definiert ist und wie sie aktualisiert wird. Berücksichtige die Frage zur GPU Nutzung, indem du den DeepVariant Container und die Pipeline Konfiguration auf GPU Unterstützung prüfst.
Tech Stack
pythontensorflowdocker
Domain
datamachine learning
Issue Type
Funktion
SchwierigkeitGeschätzte Implementierungsschwierigkeit für neue Contributors, von 1 für sehr kleine Änderungen bis 5 für Expertenarbeit.
2
Geschätzte ZeitEin grober Zeitrahmen, um zu recherchieren, zu implementieren, zu testen und einen Pull Request vorzubereiten.
1-3 Stunden
AktivitätsstatusWie verfügbar das Issue gerade wirkt: frisch, aktiv, stale, blockiert oder wartet auf Maintainer-Input.
Aktiv
KlarheitWie klar das Issue die erwartete Änderung, Akzeptanzkriterien und den nächsten Schritt erklärt.
Meist klar
Voraussetzungen
GitNextflowDocker
EinsteigerfreundlichkeitEin Score von 1 bis 100, der schätzt, wie zugänglich dieses Issue für First-Time Contributors ist.
75