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tseemann/.github

Summary of the torstyverse bioinformatics softwate suite

最近提交 2026年2月8日

 (5 stars) (0 forks) (0 个已索引 issue) (0 个开放 good first issue)
tseemann/2013-caltech-workshopPython

最近提交 2013年10月31日

 (0 stars) (0 forks) (0 个已索引 issue) (0 个开放 good first issue)
tseemann/ClonalFrameMLC++

ClonalFrameML: Efficient Inference of Recombination in Whole Bacterial Genomes

最近提交 2019年8月27日

 (2 stars) (0 forks) (0 个已索引 issue) (0 个开放 good first issue)
tseemann/FriPanJavaScript

Interactive, web tool for exploring pan-genome of bacterial strains

最近提交 2017年3月21日

 (0 stars) (0 forks) (0 个已索引 issue) (0 个开放 good first issue)
tseemann/GraphAlignerC++

最近提交 2019年10月7日

 (1 star) (0 forks) (0 个已索引 issue) (0 个开放 good first issue)
tseemann/MUMmer3C++

MUMmer3

最近提交 2013年4月30日

 (0 stars) (0 forks) (0 个已索引 issue) (0 个开放 good first issue)
tseemann/MapCallerC

MapCaller – An efficient and versatile approach for short-read alignment and variant detection in high-throughput sequenced genomes

最近提交 2020年2月16日

 (0 stars) (1 fork) (0 个已索引 issue) (0 个开放 good first issue)
tseemann/MashC++

Fast genome and metagenome distance estimation using MinHash

最近提交 2019年10月18日

 (0 stars) (0 forks) (0 个已索引 issue) (0 个开放 good first issue)
tseemann/PEARC

Pair-End AssembeR

最近提交 2014年4月16日

 (35 stars) (44 forks) (0 个已索引 issue) (0 个开放 good first issue)
tseemann/PEATC++

An ultra fast and accurate paired-end adapter trimmer that needs no a priori adapter sequences.

最近提交 2015年3月4日

 (0 stars) (1 fork) (0 个已索引 issue) (0 个开放 good first issue)
tseemann/PIRATEPerl

A toolbox for pangenome analysis and threshold evaluation.

最近提交 2019年9月30日

 (2 stars) (2 forks) (0 个已索引 issue) (0 个开放 good first issue)
tseemann/ProdigalC

Prodigal Gene Prediction Software

最近提交 2015年2月18日

 (0 stars) (0 forks) (0 个已索引 issue) (0 个开放 good first issue)
tseemann/RoaryPerl

Rapid large-scale prokaryote pan genome analysis

最近提交 2019年11月1日

 (3 stars) (1 fork) (0 个已索引 issue) (0 个开放 good first issue)
tseemann/SeqSeroPython

Salmonella serotyping from genome sequencing data

最近提交 2018年9月3日

 (1 star) (1 fork) (0 个已索引 issue) (0 个开放 good first issue)
tseemann/SpartanBioinformaticsHTML

最近提交 2019年5月27日

 (1 star) (0 forks) (0 个已索引 issue) (0 个开放 good first issue)
tseemann/TBProfilerPython

Profiling tool for Mycobacterium tuberculosis to detect ressistance and strain type from WGS data

最近提交 2020年3月5日

 (2 stars) (0 forks) (0 个已索引 issue) (0 个开放 good first issue)
tseemann/TOASTShell

The Other Alternative Sequence Type

最近提交 2026年2月27日

 (1 star) (0 forks) (0 个已索引 issue) (0 个开放 good first issue)
tseemann/TZMDPerl

最近提交 2018年10月10日

 (0 stars) (0 forks) (0 个已索引 issue) (0 个开放 good first issue)
tseemann/UnicyclerC++

hybrid assembly pipeline for bacterial genomes

最近提交 2019年10月21日

 (0 stars) (1 fork) (0 个已索引 issue) (0 个开放 good first issue)
tseemann/VelvetOptimiserPerl

:chart_with_upwards_trend: Automatically optimise three of Velvet's assembly parameters.

最近提交 2017年12月21日

 (50 stars) (17 forks) (0 个已索引 issue) (0 个开放 good first issue)