sanger-tol/sequencecomposition

Gap coordinates report

开放

#54 创建于 2026年6月4日

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描述

Description of feature

Run seqtk gap -l 0 to get a BED file with the gap coordinates. Send the file to bgzip, tabix, etc.

This would be the time we introduce a list of "tools" or "steps" that the user could configure

贡献者指南

研究方向
调查Nextflow工作流，了解步骤是如何定义和参数化的，然后设计一个可配置的选项，通过运行`seqtk gap l 0`并处理bgzip和tabix的输出来添加gap坐标报告。
技术栈
groovyshell
领域
bioinformatics
议题类型
功能
难度面向新贡献者的预计实现难度，1 表示很小改动，5 表示专家级工作。
3
预计时间有经验贡献者完成调查、实现、测试并准备 pull request 的粗略时间范围。
1-2 天
活动状态议题当前的可参与程度：新鲜、活跃、陈旧、阻塞或等待维护者输入。
新近可参与
清晰度议题是否清楚说明期望改动、验收标准和下一步。
清晰
前置要求
GitNextflow
新手友好度1-100 的估计分数，表示该议题对首次贡献者的友好程度。
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