LTR retrotransposons from `LTRharvest`

仓库指标

星标

2 个星标 (2 个星标)

PR 合并指标

PR 指标待抓取 (PR 指标待抓取)

描述

贡献者指南

研究方向

探索GDA流水线（https://github.com/sanger tol/gda）以定位处理LTR逆转录转座子的代码，特别是使用LTRharvest的模块或进程。理解GDA流水线如何集成此功能及其预期的输入/输出。然后将其与sequencecomposition的结构进行比较，确定在何处以及如何添加类似功能，遵循现有的Nextflow模块和工作流模式。

技术栈

groovy

领域

bioinformatics

议题类型

功能

难度面向新贡献者的预计实现难度，1 表示很小改动，5 表示专家级工作。

3

预计时间有经验贡献者完成调查、实现、测试并准备 pull request 的粗略时间范围。

1-2 天

活动状态议题当前的可参与程度：新鲜、活跃、陈旧、阻塞或等待维护者输入。

活跃

清晰度议题是否清楚说明期望改动、验收标准和下一步。

需要先调研

前置要求

GitNextflow

新手友好度1-100 的估计分数，表示该议题对首次贡献者的友好程度。

50