Miladeb77/Y2_Genepanel_project

Bed file integration

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#3 创建于 2024年11月20日

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描述

Issue:

I have managed to extract the gene name start, end and chromosome from ensembl api. However, I am having trouble figuring out how to convert this to a bed file with all the transcripts for the gene

贡献者指南

研究方向
研究如何使用Ensembl REST API获取基因的所有转录本，并了解BED文件格式。然后探索如何将基因坐标映射到转录本坐标，并使用Python生成BED文件。
技术栈
python
领域
data
议题类型
功能
难度面向新贡献者的预计实现难度，1 表示很小改动，5 表示专家级工作。
3
预计时间有经验贡献者完成调查、实现、测试并准备 pull request 的粗略时间范围。
半天
活动状态议题当前的可参与程度：新鲜、活跃、陈旧、阻塞或等待维护者输入。
活跃
清晰度议题是否清楚说明期望改动、验收标准和下一步。
基本清晰
前置要求
Git
新手友好度1-100 的估计分数，表示该议题对首次贡献者的友好程度。
65