sanger-tol/sequencecomposition

Gap coordinates report

開放

#54 建立於 2026年6月4日

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描述

Description of feature

Run seqtk gap -l 0 to get a BED file with the gap coordinates. Send the file to bgzip, tabix, etc.

This would be the time we introduce a list of "tools" or "steps" that the user could configure

貢獻者指南

研究方向
調查Nextflow工作流，了解步驟是如何定義和參數化的，然後設計一個可配置的選項，通過運行`seqtk gap l 0`並處理bgzip和tabix的輸出來添加gap座標報告。
技術棧
groovyshell
領域
bioinformatics
議題類型
功能
難度面向新貢獻者的預計實作難度，1 表示很小改動，5 表示專家級工作。
3
預計時間有經驗貢獻者完成調查、實作、測試並準備 pull request 的粗略時間範圍。
1-2 天
活動狀態議題目前的可參與程度：新鮮、活躍、陳舊、阻塞或等待維護者輸入。
新近可參與
清晰度議題是否清楚說明預期改動、驗收標準和下一步。
清晰
前置要求
GitNextflow
新手友善度1-100 的估計分數，表示該議題對首次貢獻者的友善程度。
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