Genome mappability

倉庫指標

星標

2 顆星 (2 顆星)

PR 合併指標

PR 指標待抓取 (PR 指標待抓取)

描述

貢獻者指南

研究方向

首先探索倉庫結構和現有的Nextflow模組，了解目前如何計算和報告統計數據。確定主工作流文件以及進程如何定義。然後研究如何添加新的可映射性（mappability）計算進程。考慮使用WGSIM從基因組模擬讀取，然後將這些讀取比對回基因組，並計算比對上的百分比。檢查項目中的容器配置（如Docker或Conda），了解外部工具是如何集成的。

技術棧

無

領域

data

議題類型

功能

難度面向新貢獻者的預計實作難度，1 表示很小改動，5 表示專家級工作。

3

預計時間有經驗貢獻者完成調查、實作、測試並準備 pull request 的粗略時間範圍。

1-2 天

活動狀態議題目前的可參與程度：新鮮、活躍、陳舊、阻塞或等待維護者輸入。

活躍

清晰度議題是否清楚說明預期改動、驗收標準和下一步。

清晰

前置要求

GitNextflow

新手友善度1-100 的估計分數，表示該議題對首次貢獻者的友善程度。

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