LTR retrotransposons from `LTRharvest`

倉庫指標

星標

2 顆星 (2 顆星)

PR 合併指標

PR 指標待抓取 (PR 指標待抓取)

描述

貢獻者指南

研究方向

探索GDA流水線（https://github.com/sanger tol/gda）以定位處理LTR逆轉錄轉座子的代碼，特別是使用LTRharvest的模組或進程。理解GDA流水線如何整合此功能及其預期的輸入/輸出。然後將其與sequencecomposition的結構進行比較，確定在何處以及如何添加類似功能，遵循現有的Nextflow模組和工作流模式。

技術棧

groovy

領域

bioinformatics

議題類型

功能

難度面向新貢獻者的預計實作難度，1 表示很小改動，5 表示專家級工作。

3

預計時間有經驗貢獻者完成調查、實作、測試並準備 pull request 的粗略時間範圍。

1-2 天

活動狀態議題目前的可參與程度：新鮮、活躍、陳舊、阻塞或等待維護者輸入。

活躍

清晰度議題是否清楚說明預期改動、驗收標準和下一步。

需要先調研

前置要求

GitNextflow

新手友善度1-100 的估計分數，表示該議題對首次貢獻者的友善程度。

50