sanger-tol/sequencecomposition

Tandem repeats from `trf`

開放

#17 建立於 2024年6月2日

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倉庫指標

星標
 (2 顆星)
PR 合併指標
 (PR 指標待抓取)

描述

Copy the functionality from the GDA pipeline. Software available at https://github.com/Benson-Genomics-Lab/TRF.

貢獻者指南

研究方向
檢查GDA管道的源代碼，了解如何使用TRF進行串聯重複序列檢測，然後定位此倉庫中相應的流程結構以添加類似步驟。確認TRF是否已包含在任何容器中，或者需要添加。
技術棧
shell
領域
dataanalytics
議題類型
功能
難度面向新貢獻者的預計實作難度，1 表示很小改動，5 表示專家級工作。
3
預計時間有經驗貢獻者完成調查、實作、測試並準備 pull request 的粗略時間範圍。
1-2 天
活動狀態議題目前的可參與程度：新鮮、活躍、陳舊、阻塞或等待維護者輸入。
活躍
清晰度議題是否清楚說明預期改動、驗收標準和下一步。
大致清晰
前置要求
GitNextflow
新手友善度1-100 的估計分數，表示該議題對首次貢獻者的友善程度。
55