Support filename with spaces

Métricas do repositório

Stars

299 estrelas (299 estrelas)

Métricas de merge de PR

Nenhuma PRs mesclada em 30d (Nenhuma PRs mesclada em 30d)

Description

FASTA file to format: /passenger/yannick/sequenceserver/databases/query sadf copy.fa
FASTA type: nucleotide
Proceed? [y/n] (Default: y): y
Enter a database title or will use 'query sadf copy':
Enter taxid (optional):
Could not create BLAST database for: /passenger/yannick/sequenceserver/databases/query sadf copy.fa
Tried: makeblastdb -parse_seqids -hash_index -in '/passenger/yannick/sequenceserver/databases/query sadf copy.fa' -dbtype nucl -title 'query sadf copy' -taxid 0
stdout:
stderr: BLAST options error: Please provide a database name using -out

Guia do colaborador

Direção de pesquisa

Investigue o código que constrói o comando makeblastdb. Certifique se de que, quando o nome do arquivo de entrada contém espaços, o comando inclua corretamente a opção ' out' com um nome de banco de dados válido.

Pilha de tecnologia

javascript

Domain

backend

Tipo Issue

Bug

DifficultyDificuldade de implementação estimada para um novo contribuidor, de 1 para alterações muito pequenas a 5 para trabalho de nível especializado.

3

Tempo estimadoUm intervalo de tempo aproximado para um colaborador experiente investigar, implementar, testar e preparar um pull request.

1-3 horas

Status da atividadeQuão disponível o issue aparece agora: novo, ativo, obsoleto, bloqueado ou aguardando entrada do mantenedor.

Ativo

ClarityCom que clareza o issue explica a mudança esperada, os critérios de aceitação e a próxima etapa.

Claro

Prerequisites

Basic command lineBLAST understanding

Simpatia para novatosUma pontuação de 1 a 100 que estima o quão acessível este issue é para colaboradores iniciantes.

60