wurmlab/sequenceserver

limit query size and customize /tmp dir

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#535 aberto em 22 de jul. de 2021

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Description

We set up a sequenceserver app for public and usually the /tmp dir would ran out of disk storage because of long DNA query sizes resulting in large temporary files.

Therefore two configs are needed: (1) an option that limits the maxium input sequence lengths (2) an option that customize a directory for temporary files.

Guia do colaborador

Direção de pesquisa
Adicione duas opções de configuração: uma para definir um limite máximo de comprimento da sequência de entrada e outra para especificar um diretório temporário personalizado. Implemente as no arquivo de configuração do servidor (por exemplo, config.ru ou settings) e atualize qualquer código relevante que lide com upload de arquivos ou criação de arquivos temporários.
Pilha de tecnologia
javascript
Domain
backend
Tipo Issue
Funcionalidade
DifficultyDificuldade de implementação estimada para um novo contribuidor, de 1 para alterações muito pequenas a 5 para trabalho de nível especializado.
2
Tempo estimadoUm intervalo de tempo aproximado para um colaborador experiente investigar, implementar, testar e preparar um pull request.
1-3 horas
Status da atividadeQuão disponível o issue aparece agora: novo, ativo, obsoleto, bloqueado ou aguardando entrada do mantenedor.
Ativo
ClarityCom que clareza o issue explica a mudança esperada, os critérios de aceitação e a próxima etapa.
Claro
Prerequisites
Git
Simpatia para novatosUma pontuação de 1 a 100 que estima o quão acessível este issue é para colaboradores iniciantes.
70