wurmlab/sequenceserver

bed or gff alternate table format outputs

Aberta

#501 aberto em 19 de nov. de 2020

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Description

We should enable a slightly-modified table output format that is gff or bed-like and can thus be more easily read into IGV

Guia do colaborador

Direção de pesquisa
Investigue a geração atual de saída de tabela no código, entenda a análise de resultados BLAST e implemente um novo serializador para o formato BED ou GFF.
Pilha de tecnologia
javascript
Domain
backenddata visualization
Tipo Issue
Funcionalidade
DifficultyDificuldade de implementação estimada para um novo contribuidor, de 1 para alterações muito pequenas a 5 para trabalho de nível especializado.
2
Tempo estimadoUm intervalo de tempo aproximado para um colaborador experiente investigar, implementar, testar e preparar um pull request.
1-3 horas
Status da atividadeQuão disponível o issue aparece agora: novo, ativo, obsoleto, bloqueado ou aguardando entrada do mantenedor.
Ativo
ClarityCom que clareza o issue explica a mudança esperada, os critérios de aceitação e a próxima etapa.
Principalmente claro
Prerequisites
Git
Simpatia para novatosUma pontuação de 1 a 100 que estima o quão acessível este issue é para colaboradores iniciantes.
70