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Repositórios de tseemann

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tseemann/.github

Summary of the torstyverse bioinformatics softwate suite

Último commit 8 de fev. de 2026

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tseemann/2013-caltech-workshopPython

Último commit 31 de out. de 2013

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tseemann/ClonalFrameMLC++

ClonalFrameML: Efficient Inference of Recombination in Whole Bacterial Genomes

Último commit 27 de ago. de 2019

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tseemann/FriPanJavaScript

Interactive, web tool for exploring pan-genome of bacterial strains

Último commit 21 de mar. de 2017

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tseemann/GraphAlignerC++

Último commit 7 de out. de 2019

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tseemann/MUMmer3C++

MUMmer3

Último commit 30 de abr. de 2013

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tseemann/MapCallerC

MapCaller – An efficient and versatile approach for short-read alignment and variant detection in high-throughput sequenced genomes

Último commit 16 de fev. de 2020

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tseemann/MashC++

Fast genome and metagenome distance estimation using MinHash

Último commit 18 de out. de 2019

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tseemann/PEARC

Pair-End AssembeR

Último commit 16 de abr. de 2014

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tseemann/PEATC++

An ultra fast and accurate paired-end adapter trimmer that needs no a priori adapter sequences.

Último commit 4 de mar. de 2015

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tseemann/PIRATEPerl

A toolbox for pangenome analysis and threshold evaluation.

Último commit 30 de set. de 2019

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tseemann/ProdigalC

Prodigal Gene Prediction Software

Último commit 18 de fev. de 2015

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tseemann/RoaryPerl

Rapid large-scale prokaryote pan genome analysis

Último commit 1 de nov. de 2019

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tseemann/SeqSeroPython

Salmonella serotyping from genome sequencing data

Último commit 3 de set. de 2018

 (1 star) (1 fork) (0 issues indexadas) (0 good first issues abertas)
tseemann/SpartanBioinformaticsHTML

Último commit 27 de mai. de 2019

 (1 star) (0 forks) (0 issues indexadas) (0 good first issues abertas)
tseemann/TBProfilerPython

Profiling tool for Mycobacterium tuberculosis to detect ressistance and strain type from WGS data

Último commit 5 de mar. de 2020

 (2 stars) (0 forks) (0 issues indexadas) (0 good first issues abertas)
tseemann/TOASTShell

The Other Alternative Sequence Type

Último commit 27 de fev. de 2026

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tseemann/TZMDPerl

Último commit 10 de out. de 2018

 (0 stars) (0 forks) (0 issues indexadas) (0 good first issues abertas)
tseemann/UnicyclerC++

hybrid assembly pipeline for bacterial genomes

Último commit 21 de out. de 2019

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tseemann/VelvetOptimiserPerl

:chart_with_upwards_trend: Automatically optimise three of Velvet's assembly parameters.

Último commit 21 de dez. de 2017

 (50 stars) (17 forks) (0 issues indexadas) (0 good first issues abertas)