pymc-devs/pymc

Add function that goes from transformed space to untransformed space

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#6.721 aberto em 18 de mai. de 2023

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Description

Description

Because we don't save transformed variables in the returned InferenceData (why not?) it's not easy to evaluate the model logp once we have a trace.

One could rewrite the model without transforms (and we can make this automatically for the user) This is possible with https://www.pymc.io/projects/docs/en/stable/api/model/generated/pymc.model.transform.conditioning.remove_value_transforms.html

But someone might still want to evaluate it in the original model (with jacobians and all that).

One dirty implementation is given here: https://discourse.pymc.io/t/logp-questions-synthetic-dataset-to-evaluate-modeling/12129/6?u=ricardov94

Guia do colaborador

Direção de pesquisa
Investigue a função existente `remove value transforms` em pymc.model.transform.conditioning para entender o suporte atual para avaliação sem transformações. Revise a postagem do Discourse vinculada na issue para uma possível abordagem de implementação. Examine como as variáveis transformadas são armazenadas no InferenceData para determinar a melhor maneira de expor uma função de transformação inversa.
Pilha de tecnologia
python
Domain
machine learning
Tipo Issue
Funcionalidade
DifficultyDificuldade de implementação estimada para um novo contribuidor, de 1 para alterações muito pequenas a 5 para trabalho de nível especializado.
3
Tempo estimadoUm intervalo de tempo aproximado para um colaborador experiente investigar, implementar, testar e preparar um pull request.
1-3 horas
Status da atividadeQuão disponível o issue aparece agora: novo, ativo, obsoleto, bloqueado ou aguardando entrada do mantenedor.
Antigo
ClarityCom que clareza o issue explica a mudança esperada, os critérios de aceitação e a próxima etapa.
Claro
Prerequisites
PythonPyMCBayesian inferencetransforms
Simpatia para novatosUma pontuação de 1 a 100 que estima o quão acessível este issue é para colaboradores iniciantes.
40