pymc-devs/pymc

Add function that goes from transformed space to untransformed space

Fechada

#6.721 aberto em 18 de mai. de 2023

Ver no GitHubGuia do colaborador
 (3 comentários) (0 reação) (0 responsável)Python (1.902 forks)batch import
enhancementshelp wantedtrace-backend

Métricas do repositório

Stars
 (7.926 estrelas)
Métricas de merge de PR
 (Mesclagem média 11d) (7 fundiu PRs em 30d)

Description

Description

Because we don't save transformed variables in the returned InferenceData (why not?) it's not easy to evaluate the model logp once we have a trace.

One could rewrite the model without transforms (and we can make this automatically for the user) This is possible with https://www.pymc.io/projects/docs/en/stable/api/model/generated/pymc.model.transform.conditioning.remove_value_transforms.html

But someone might still want to evaluate it in the original model (with jacobians and all that).

One dirty implementation is given here: https://discourse.pymc.io/t/logp-questions-synthetic-dataset-to-evaluate-modeling/12129/6?u=ricardov94

Guia do colaborador

Direção de pesquisa
Investigue a função existente `remove value transforms` em pymc.model.transform.conditioning para entender o suporte atual para avaliação sem transformações. Revise a postagem do Discourse vinculada na issue para uma possível abordagem de implementação. Examine como as variáveis transformadas são armazenadas no InferenceData para determinar a melhor maneira de expor uma função de transformação inversa.
Pilha de tecnologia
python
Domain
machine learning
Tipo Issue
Funcionalidade
DifficultyDificuldade de implementação estimada para um novo contribuidor, de 1 para alterações muito pequenas a 5 para trabalho de nível especializado.
3
Tempo estimadoUm intervalo de tempo aproximado para um colaborador experiente investigar, implementar, testar e preparar um pull request.
1-3 horas
Status da atividadeQuão disponível o issue aparece agora: novo, ativo, obsoleto, bloqueado ou aguardando entrada do mantenedor.
Antigo
ClarityCom que clareza o issue explica a mudança esperada, os critérios de aceitação e a próxima etapa.
Claro
Prerequisites
PythonPyMCBayesian inferencetransforms
Simpatia para novatosUma pontuação de 1 a 100 que estima o quão acessível este issue é para colaboradores iniciantes.
40