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Expand `.splitCsv()` to allow comments in CSV and TSV files

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#6.705 aberto em 8 de jan. de 2026

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 (6 comments) (1 reaction) (0 assignees)Groovy (784 forks)batch import
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Description

New feature

Someone opened a feature request on nf-schema to ask to allow comments (#) in CSV and TSV files. I however think this would be an awesome upstream addition to the .splitCsv() method so everyone can benefit from that feature. Comments syntax as explained here makes the most sense I think: https://www.w3schools.io/file/csv-comments/

Use case

Easier debugging in CSV and TSV files by allowing directly commenting out lines in those files. This could also help to add some comments and explanation to those files without breaking them.

Suggested implementation

I think this should not be default behaviour of the function but adding an option like comments:true would be an ideal solution IMO

Thanks!

Guia do colaborador

Direção de pesquisa
Examine o código fonte de `.splitCsv()` no Nextflow e implemente um parâmetro opcional `comments` que ignore linhas começando com `#` após analisar corretamente a sintaxe CSV/TSV. Considere casos extremos como campos entre aspas contendo `#`.
Pilha de tecnologia
groovy
Domain
backenddevops
Tipo Issue
Funcionalidade
DifficultyDificuldade de implementação estimada para um novo contribuidor, de 1 para alterações muito pequenas a 5 para trabalho de nível especializado.
3
Tempo estimadoUm intervalo de tempo aproximado para um colaborador experiente investigar, implementar, testar e preparar um pull request.
1-2 dias
Status da atividadeQuão disponível o issue aparece agora: novo, ativo, obsoleto, bloqueado ou aguardando entrada do mantenedor.
Ativo
ClarityCom que clareza o issue explica a mudança esperada, os critérios de aceitação e a próxima etapa.
Claro
Prerequisites
GroovyNextflow
Simpatia para novatosUma pontuação de 1 a 100 que estima o quão acessível este issue é para colaboradores iniciantes.
50