nextflow-io/nextflow

nextflow clone does not clone commit hashes

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#1.987 aberto em 24 de mar. de 2021

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Description

Bug report

This set of commands:

nextflow drop pipelines/mypipeline
nextflow clone pipelines/mypipeline -hub my_bitbucket -r 0c7ef9be953

Results in an empty directory with the .git sub directory. No error is reported. The same command seems to work well with branches - it seems to be a commit-specific bug. Similar behavior was observed with nextflow pull && nextflow clone commands.

Environment

  • Nextflow version:20.10.0

Guia do colaborador

Direção de pesquisa
Investigue a implementação do comando 'nextflow clone' em Groovy, provavelmente em arquivos relacionados à clonagem de repositório. Concentre se em como o parâmetro de revisão ( r) é tratado quando é um hash de commit versus um nome de branch. Procure diferenças nos comandos Git executados (por exemplo, git checkout vs git clone branch). Revise quaisquer testes existentes para o comando clone para entender o comportamento esperado.
Pilha de tecnologia
None
Domain
clibackend
Tipo Issue
Bug
DifficultyDificuldade de implementação estimada para um novo contribuidor, de 1 para alterações muito pequenas a 5 para trabalho de nível especializado.
2
Tempo estimadoUm intervalo de tempo aproximado para um colaborador experiente investigar, implementar, testar e preparar um pull request.
1-3 horas
Status da atividadeQuão disponível o issue aparece agora: novo, ativo, obsoleto, bloqueado ou aguardando entrada do mantenedor.
Ativo
ClarityCom que clareza o issue explica a mudança esperada, os critérios de aceitação e a próxima etapa.
Claro
Prerequisites
Git
Simpatia para novatosUma pontuação de 1 a 100 que estima o quão acessível este issue é para colaboradores iniciantes.
70