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Need protective namespace for common (proteinogenic) amino acids

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#13 aberto em 29 de nov. de 2025

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Description

Right now display names for motifs are auto-generated as first three capitalized alphanumeric characters of the full name. This can lead to confusing abbreviations, like MET for METhylation and ASP for both ASParagine and ASPartic acid. We need to create a protected namespace for proteinogenic amino acids and make sure other motifs will not have those three-letter abbreviations.

Guia do colaborador

Direção de pesquisa
Investigue a lógica de abreviação atual no código, depois implemente uma tabela de consulta ou conjunto de códigos de três letras protegidos para aminoácidos proteinogênicos e garanta que outros motivos evitem colisões.
Pilha de tecnologia
typescript
Domain
frontend
Tipo Issue
Funcionalidade
DifficultyDificuldade de implementação estimada para um novo contribuidor, de 1 para alterações muito pequenas a 5 para trabalho de nível especializado.
2
Tempo estimadoUm intervalo de tempo aproximado para um colaborador experiente investigar, implementar, testar e preparar um pull request.
1-3 horas
Status da atividadeQuão disponível o issue aparece agora: novo, ativo, obsoleto, bloqueado ou aguardando entrada do mantenedor.
Recente
ClarityCom que clareza o issue explica a mudança esperada, os critérios de aceitação e a próxima etapa.
Claro
Prerequisites
GitTypeScript
Simpatia para novatosUma pontuação de 1 a 100 que estima o quão acessível este issue é para colaboradores iniciantes.
80