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Patch visualization: Highlight that areas that are never sampled

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#301 aberto em 28 de out. de 2020

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good first issuenot urgentreporting and diagnostics

Description

From the present thumbnails, it is not clear which pixels will never be included in training. Can we highlight those in a different color?

AB#3939

Guia do colaborador

Pilha de tecnologia
python
Domain
machine learningdata
Tipo Issue
feature
DifficultyDificuldade de implementação estimada para um novo contribuidor, de 1 para alterações muito pequenas a 5 para trabalho de nível especializado.
3
Tempo estimadoUm intervalo de tempo aproximado para um colaborador experiente investigar, implementar, testar e preparar um pull request.
half day
Status da atividadeQuão disponível o issue aparece agora: novo, ativo, obsoleto, bloqueado ou aguardando entrada do mantenedor.
fresh
ClarityCom que clareza o issue explica a mudança esperada, os critérios de aceitação e a próxima etapa.
mostly clear
Prerequisites
Understanding of patch sampling in medical imagingFamiliarity with visualization code in the repository
Simpatia para novatosUma pontuação de 1 a 100 que estima o quão acessível este issue é para colaboradores iniciantes.
60
Direção de pesquisa
Examine the existing thumbnail generation code in the repository (likely in the visualization module) to understand how patches are currently displayed. Identify the logic that determines which pixels are sampled for training. Modify the visualization to color unsampled pixels differently, e.g., by adding a semi transparent overlay. Review any related documentation or comments about sampling strategies to ensure accuracy.