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Show histograms of selected quantitative sample metadata fields as an alternative to the "sample presence information" table

Aberta

#443 aberto em 8 de nov. de 2020

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Description

The current sample presence info tables are great for summarizing categorical metadata, but they don't scale well to quantitative fields (e.g. pH). It would be really cool if we could add an option to show a histogram for the selected tip / internal node that, for each sample containing the node or its descendants, shows the distribution of values for a selected sample metadata field.

I think getting an early version of this up using Vega-Lite wouldn't be too bad.

Guia do colaborador

Direção de pesquisa
Explore o Vega Lite para criar um histograma interativo para um campo de metadados quantitativos selecionado, integrado ao visualizador de árvore filogenética existente.
Pilha de tecnologia
javascript
Domain
data visualizationbioinformatics
Tipo Issue
Funcionalidade
DifficultyDificuldade de implementação estimada para um novo contribuidor, de 1 para alterações muito pequenas a 5 para trabalho de nível especializado.
3
Tempo estimadoUm intervalo de tempo aproximado para um colaborador experiente investigar, implementar, testar e preparar um pull request.
1-2 dias
Status da atividadeQuão disponível o issue aparece agora: novo, ativo, obsoleto, bloqueado ou aguardando entrada do mantenedor.
Recente
ClarityCom que clareza o issue explica a mudança esperada, os critérios de aceitação e a próxima etapa.
Claro
Prerequisites
GitJavaScript
Simpatia para novatosUma pontuação de 1 a 100 que estima o quão acessível este issue é para colaboradores iniciantes.
60