sanger-tol/sequencecomposition

Tandem repeats from `trf`

オープン

#17 opened on 2024/06/02

GitHub で見るコントリビューターガイド
 (1 件のコメント) (0 件のリアクション) (0 人の担当者)Nextflow (3 件のフォーク)auto 404
good first issuehelp wanted

Repository metrics

Stars
 (2 個のスター)
PR merge metrics
 (PR metrics pending)

説明

Copy the functionality from the GDA pipeline. Software available at https://github.com/Benson-Genomics-Lab/TRF.

コントリビューターガイド

調査方針
GDAパイプラインのソースコードを調べて、TRFをタンデムリピート検出にどのように使用しているかを理解し、このリポジトリの対応するプロセス構造を見つけて同様のステップを追加してください。TRFがコンテナに既に含まれているか、追加が必要かを確認してください。
技術スタック
shell
領域
dataanalytics
Issue 種別
機能
難度新しい貢献者にとっての実装難度です。1 は非常に小さな変更、5 は専門的な作業です。
3
推定時間経験ある貢献者が調査、実装、テスト、pull request 準備にかけるおおよその時間範囲です。
1-2日
活動状況Issue が今どれだけ取り組みやすいかを示します。新しい、活発、古い、ブロック中、またはメンテナー入力待ちなどです。
アクティブ
明確さ期待される変更、受け入れ条件、次の手順がどれだけ明確かを示します。
おおむね明確
前提条件
GitNextflow
初心者向け度初回貢献者にどれだけ取り組みやすいかを 1-100 で推定したスコアです。
55