wurmlab/sequenceserver

bed or gff alternate table format outputs

Aperta

#501 aperta il 19 nov 2020

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Descrizione

We should enable a slightly-modified table output format that is gff or bed-like and can thus be more easily read into IGV

Guida contributor

Direzione di ricerca
Investigare la generazione dell'output tabellare corrente nel codebase, comprendere l'analisi dei risultati BLAST e implementare un nuovo serializzatore per il formato BED o GFF.
Tech stack
javascript
Dominio
backenddata visualization
Tipo issue
Funzionalità
DifficoltàQuanto dovrebbe essere impegnativa per un nuovo contributor.
2
Tempo stimatoTempo stimato per completare e verificare uno scope piccolo.
1-3 ore
Stato attivitàQuanto è probabile che la issue sia ancora attiva e reviewable.
Attiva
ChiarezzaQuanto chiaramente la issue descrive problema, scope e risultato atteso.
Abbastanza chiara
Prerequisiti
Git
Adatta ai principiantiQuanto la issue è adatta a contributor alla prima esperienza.
70