sanger-tol/sequencecomposition

DFAM

Aperta

#25 aperta il 17 giu 2024

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Metriche repository

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Descrizione

Copy the functionality from the GDA pipeline.

Essentially, this is running hmmscan across the entire genome.

Guida contributor

Direzione di ricerca
Esamina la pipeline GDA per capire come viene implementato hmmscan, quindi integra la funzionalità equivalente in questa pipeline Nextflow.
Tech stack
Nessuno
Dominio
data engineering
Tipo issue
Funzionalità
DifficoltàQuanto dovrebbe essere impegnativa per un nuovo contributor.
3
Tempo stimatoTempo stimato per completare e verificare uno scope piccolo.
Mezza giornata
Stato attivitàQuanto è probabile che la issue sia ancora attiva e reviewable.
Nuova
ChiarezzaQuanto chiaramente la issue descrive problema, scope e risultato atteso.
Abbastanza chiara
Prerequisiti
GitNextflow
Adatta ai principiantiQuanto la issue è adatta a contributor alla prima esperienza.
50