sanger-tol/sequencecomposition

Tandem repeats from `trf`

Aperta

#17 aperta il 2 giu 2024

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Metriche repository

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Descrizione

Copy the functionality from the GDA pipeline. Software available at https://github.com/Benson-Genomics-Lab/TRF.

Guida contributor

Direzione di ricerca
Ispeziona il codice sorgente del pipeline GDA per capire come viene utilizzato TRF per il rilevamento di ripetizioni in tandem, quindi individua la struttura dei processi corrispondente in questo repository per aggiungere un passaggio simile. Verifica se TRF è già incluso in un contenitore o se deve essere aggiunto.
Tech stack
shell
Dominio
dataanalytics
Tipo issue
Funzionalità
DifficoltàQuanto dovrebbe essere impegnativa per un nuovo contributor.
3
Tempo stimatoTempo stimato per completare e verificare uno scope piccolo.
1-2 giorni
Stato attivitàQuanto è probabile che la issue sia ancora attiva e reviewable.
Attiva
ChiarezzaQuanto chiaramente la issue descrive problema, scope e risultato atteso.
Abbastanza chiara
Prerequisiti
GitNextflow
Adatta ai principiantiQuanto la issue è adatta a contributor alla prima esperienza.
55