pymc-devs/pymc

Add function that goes from transformed space to untransformed space

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#6721 aperta il 18 mag 2023

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Descrizione

Description

Because we don't save transformed variables in the returned InferenceData (why not?) it's not easy to evaluate the model logp once we have a trace.

One could rewrite the model without transforms (and we can make this automatically for the user) This is possible with https://www.pymc.io/projects/docs/en/stable/api/model/generated/pymc.model.transform.conditioning.remove_value_transforms.html

But someone might still want to evaluate it in the original model (with jacobians and all that).

One dirty implementation is given here: https://discourse.pymc.io/t/logp-questions-synthetic-dataset-to-evaluate-modeling/12129/6?u=ricardov94

Guida contributor

Direzione di ricerca
Esamina la funzione esistente `remove value transforms` in pymc.model.transform.conditioning per comprendere il supporto attuale per la valutazione senza trasformazioni. Rivedi il post su Discourse collegato nell'issue per un possibile approccio di implementazione. Esamina come le variabili trasformate sono memorizzate in InferenceData per determinare il modo migliore per esporre una funzione di trasformazione inversa.
Tech stack
python
Dominio
machine learning
Tipo issue
Funzionalità
DifficoltàQuanto dovrebbe essere impegnativa per un nuovo contributor.
3
Tempo stimatoTempo stimato per completare e verificare uno scope piccolo.
1-3 ore
Stato attivitàQuanto è probabile che la issue sia ancora attiva e reviewable.
Datata
ChiarezzaQuanto chiaramente la issue descrive problema, scope e risultato atteso.
Chiara
Prerequisiti
PythonPyMCBayesian inferencetransforms
Adatta ai principiantiQuanto la issue è adatta a contributor alla prima esperienza.
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