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List node features can not be sliced with subgraph

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#6162 aperta il 7 dic 2022

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Descrizione

How to pass subgraph Data as a node feature into main graph Data? test_data=Data(edge_index=edge_index,pos=torch.tensor(np.array(pos)), graph=subgraphList) subgraphList is as follows:

 Data(x=[1, 3], edge_index=[2, 0], pos=[1, 2]),
 ...
 Data(x=[10, 3], edge_index=[2, 18])]```
The issue is that when I tried to mask some nodes:
`mask_test_data=test_data.subgraph(mask)`
mask_test_data.graph is the same as test_data.graph, while the size of mask_test_data.pos is reduced from test_data.pos.

After testing, I found the issue is caused by the type of list. May I know whether there is another type of container in which I can store the subgraph Data, and it can auto-align with  `test_data.subgraph(mask)`?

[Slack Message](https://torchgeometricco.slack.com/archives/C01DN0B3B1N/p1670346485240969?thread_ts=1670346485.240969&cid=C01DN0B3B1N)

Guida contributor

Direzione di ricerca
Ispeziona il metodo subgraph() nella classe Data di PyG per capire come copia gli attributi. Il problema è che gli attributi lista non vengono affettati come gli attributi tensore. Esamina i metodi cat dim e inc per tipi di dati personalizzati. Considera l'uso di un contenitore personalizzato o la modifica della gestione degli attributi per supportare l'affettamento.
Tech stack
pythonpytorch
Dominio
Nessuno
Tipo issue
Bug
DifficoltàQuanto dovrebbe essere impegnativa per un nuovo contributor.
2
Tempo stimatoTempo stimato per completare e verificare uno scope piccolo.
1-3 ore
Stato attivitàQuanto è probabile che la issue sia ancora attiva e reviewable.
Attiva
ChiarezzaQuanto chiaramente la issue descrive problema, scope e risultato atteso.
Abbastanza chiara
Prerequisiti
PythonPyTorchPyG
Adatta ai principiantiQuanto la issue è adatta a contributor alla prima esperienza.
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