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Need protective namespace for common (proteinogenic) amino acids

Aperta

#13 aperta il 29 nov 2025

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Descrizione

Right now display names for motifs are auto-generated as first three capitalized alphanumeric characters of the full name. This can lead to confusing abbreviations, like MET for METhylation and ASP for both ASParagine and ASPartic acid. We need to create a protected namespace for proteinogenic amino acids and make sure other motifs will not have those three-letter abbreviations.

Guida contributor

Direzione di ricerca
Indagare la logica di abbreviazione attuale nel codice, quindi implementare una tabella di ricerca o un set di codici a tre lettere protetti per gli amminoacidi proteinogenici e assicurarsi che altri motivi evitino collisioni.
Tech stack
typescript
Dominio
frontend
Tipo issue
Funzionalità
DifficoltàQuanto dovrebbe essere impegnativa per un nuovo contributor.
2
Tempo stimatoTempo stimato per completare e verificare uno scope piccolo.
1-3 ore
Stato attivitàQuanto è probabile che la issue sia ancora attiva e reviewable.
Nuova
ChiarezzaQuanto chiaramente la issue descrive problema, scope e risultato atteso.
Chiara
Prerequisiti
GitTypeScript
Adatta ai principiantiQuanto la issue è adatta a contributor alla prima esperienza.
80